69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1858 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1858  serine/threonine-protein kinase  100 
 
 		 274 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129879 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  30.5 
 
 		 502 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  26.36 
 
 		 664 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  24.77 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  32.8 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.19 
 
 		 693 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.77 
 
 		 538 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4789  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  24.77 
 
 		 550 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.425 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  26.88 
 
 		 538 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  24.68 
 
 		 676 aa  56.6  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.23 
 
 		 526 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1030 aa  55.8  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4920  NHL repeat containing protein  27.45 
 
 		 542 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610425  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0646  gluconolactonase  27.22 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 		 732 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  29.56 
 
 		 621 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  25.4 
 
 		 379 aa  52.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  26.14 
 
 		 850 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  23.45 
 
 		 387 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4276  NHL repeat-containing protein  28.32 
 
 		 543 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0287557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4866  NHL repeat containing protein  26.02 
 
 		 510 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  23.85 
 
 		 1351 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2140  gluconolactonase  31.21 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.977178 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0291  cytochrome c, class I  29.95 
 
 		 546 aa  49.7  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.85938 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  26.82 
 
 		 770 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  26.79 
 
 		 1026 aa  49.7  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  30.3 
 
 		 359 aa  49.3  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.47 
 
 		 529 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.89 
 
 		 531 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2603  SMP-30/gluconolaconase/LRE-like region  28.8 
 
 		 331 aa  48.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776475  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  25.21 
 
 		 642 aa  48.9  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  24.33 
 
 		 831 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  24.35 
 
 		 1750 aa  47  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1635  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.46 
 
 		 545 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.260295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0570  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.38 
 
 		 334 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.910733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1611  Fibronectin type III domain protein  31.03 
 
 		 805 aa  46.2  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  0.000457229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  22.07 
 
 		 709 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  27.27 
 
 		 1667 aa  46.2  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  25.45 
 
 		 418 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.13 
 
 		 1834 aa  45.4  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0374  periplasmic ATP/GTP-binding protein  27.33 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  28.06 
 
 		 807 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  23.93 
 
 		 307 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.37 
 
 		 316 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3982  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  23.92 
 
 		 305 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0181856  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.5 
 
 		 1130 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2719  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.28 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.281224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0482  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.7 
 
 		 326 aa  44.3  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1002  NHL repeat-containing protein  30.36 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465909 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  21.53 
 
 		 284 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3770  gluconolactonase  26.29 
 
 		 323 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3070  low-density lipoprotein receptor YWTD repeat protein  27.2 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.722808  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1838  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.15 
 
 		 366 aa  43.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5161  gluconolactonase  25.97 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288477  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  26.87 
 
 		 1030 aa  42.7  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8319  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.39 
 
 		 306 aa  42.7  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.736171  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.58 
 
 		 1292 aa  42.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4272  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.32 
 
 		 307 aa  42.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0244404  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5020  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.65 
 
 		 311 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0163627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2141  hypothetical protein  26.14 
 
 		 346 aa  42.7  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2723  senescence marker protein-30 (SMP-30)  26.67 
 
 		 307 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.513574  normal  0.176551 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3573  hypothetical protein  26.54 
 
 		 367 aa  42.7  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0820856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2173  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.65 
 
 		 366 aa  42.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  26.32 
 
 		 491 aa  42.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1015  NHL repeat-containing protein  24.91 
 
 		 438 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3681  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  31.94 
 
 		 299 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2856  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  28.26 
 
 		 420 aa  42.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.656611  normal  0.0673289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5618  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.39 
 
 		 306 aa  42  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.638263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1381  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.72 
 
 		 286 aa  42  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  0.429128 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>