50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_0365 on replicon NC_008835
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  100 
 
 
657 aa  1344    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  99.39 
 
 
657 aa  1340    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  100 
 
 
657 aa  1344    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  100 
 
 
657 aa  1344    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  99.54 
 
 
657 aa  1340    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  100 
 
 
657 aa  1344    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  89.96 
 
 
667 aa  1189    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  99.7 
 
 
657 aa  1339    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  32.75 
 
 
349 aa  114  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  32.74 
 
 
331 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  26.48 
 
 
927 aa  101  4e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.11 
 
 
351 aa  100  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  24.01 
 
 
335 aa  96.3  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  27.24 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  24.55 
 
 
326 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  25.9 
 
 
416 aa  79  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  24.78 
 
 
326 aa  70.1  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  26.57 
 
 
359 aa  69.7  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  26.14 
 
 
332 aa  69.3  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  23.61 
 
 
294 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  25.37 
 
 
526 aa  57  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  24.31 
 
 
296 aa  54.3  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.97 
 
 
529 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  24.16 
 
 
328 aa  53.5  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3693  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.55 
 
 
531 aa  52.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0345166  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  23.93 
 
 
291 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  28.57 
 
 
457 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  25.61 
 
 
302 aa  51.2  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  26.36 
 
 
1024 aa  50.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  25.55 
 
 
280 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  25.55 
 
 
280 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  25.55 
 
 
280 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  29.77 
 
 
377 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  28.26 
 
 
272 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  36.19 
 
 
1170 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  27.4 
 
 
299 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  23.47 
 
 
290 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  22.74 
 
 
950 aa  46.2  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  24.38 
 
 
285 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  23.51 
 
 
1114 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  23.19 
 
 
538 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  19.25 
 
 
831 aa  45.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  28.99 
 
 
316 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  28.99 
 
 
316 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4095  TonB-dependent receptor, plug  39.19 
 
 
1123 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  23.19 
 
 
538 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0351  hypothetical protein  32.53 
 
 
653 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  25.95 
 
 
533 aa  44.3  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4246  NHL repeat-containing protein  31.03 
 
 
542 aa  44.3  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359028  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.76 
 
 
1535 aa  44.3  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>