50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2493 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2493  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 260 aa  532  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  47.31 
 
 		 303 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1126  NHL repeat containing protein  45.42 
 
 		 302 aa  248  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.330169  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  46.56 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  43.68 
 
 		 297 aa  230  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  42.41 
 
 		 297 aa  224  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1838  NHL repeat-containing protein  38.08 
 
 		 296 aa  189  4e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.32 
 
 		 930 aa  82.8  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  23.31 
 
 		 579 aa  75.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  25.91 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.27 
 
 		 668 aa  67.4  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  25.78 
 
 		 343 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  25.42 
 
 		 709 aa  64.3  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  23.32 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.79 
 
 		 343 aa  62.4  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  23.94 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  23.58 
 
 		 491 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  23.16 
 
 		 831 aa  60.8  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  24.19 
 
 		 353 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  22.81 
 
 		 676 aa  59.3  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1163 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  21.8 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  25.54 
 
 		 1293 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  23.83 
 
 		 522 aa  57  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  21.12 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  22.48 
 
 		 1146 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  23.32 
 
 		 387 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  23.85 
 
 		 391 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  23.81 
 
 		 363 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  30.9 
 
 		 588 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  25.21 
 
 		 439 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  27.2 
 
 		 347 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  23.92 
 
 		 343 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  33.08 
 
 		 448 aa  50.4  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  26.71 
 
 		 664 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  27.27 
 
 		 355 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  22.55 
 
 		 354 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  21.91 
 
 		 1030 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.78 
 
 		 1140 aa  47.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  25.83 
 
 		 355 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  26.35 
 
 		 284 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  22.76 
 
 		 379 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  20.47 
 
 		 436 aa  45.8  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  24.12 
 
 		 390 aa  45.8  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  26.67 
 
 		 850 aa  45.4  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  27.69 
 
 		 372 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  19.91 
 
 		 752 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  29.51 
 
 		 1068 aa  43.9  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0275  hypothetical protein  25.75 
 
 		 502 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  23.89 
 
 		 700 aa  43.1  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>