56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5930 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 367 aa  764    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  48.88 
 
 		 353 aa  353  2.9999999999999997e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  38.34 
 
 		 414 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.73 
 
 		 372 aa  230  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1962  peptidylglycine monooxygenase-like  35.46 
 
 		 375 aa  227  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  27.03 
 
 		 371 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  30.05 
 
 		 326 aa  94.7  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  26.98 
 
 		 318 aa  93.2  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  30.77 
 
 		 284 aa  89  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  25.25 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  28.44 
 
 		 321 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  25.72 
 
 		 323 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  25.71 
 
 		 340 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  27.04 
 
 		 328 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  26.79 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  27.22 
 
 		 364 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  27.52 
 
 		 930 aa  66.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  27.96 
 
 		 588 aa  66.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  25.09 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  26.05 
 
 		 522 aa  66.2  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.58 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  24.47 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  24.41 
 
 		 752 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  23.42 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  23.63 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  31.88 
 
 		 211 aa  55.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  25.87 
 
 		 676 aa  54.3  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  23.64 
 
 		 359 aa  53.1  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 387 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5916  NHL repeat-containing protein  25.84 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.205268  normal  0.0756085 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  22.77 
 
 		 346 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  32.65 
 
 		 660 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  26.87 
 
 		 391 aa  50.1  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  25.46 
 
 		 384 aa  49.7  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  25.29 
 
 		 418 aa  49.7  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1383  serine/threonine protein kinase  31.43 
 
 		 678 aa  49.7  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0132851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25.33 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  29.41 
 
 		 930 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  26.01 
 
 		 579 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  24.08 
 
 		 361 aa  47.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  32.52 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.4 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  24.61 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1030 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1068 aa  47  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  29.01 
 
 		 360 aa  46.6  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  26.19 
 
 		 1293 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  21.08 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.73 
 
 		 365 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 		 683 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  26.82 
 
 		 913 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  23.47 
 
 		 709 aa  43.1  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  29.63 
 
 		 521 aa  42.7  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  24.5 
 
 		 390 aa  42.7  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  23.89 
 
 		 319 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  24.21 
 
 		 379 aa  42.7  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>