45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2067 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 371 aa  774    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  32.08 
 
 		 353 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  27.03 
 
 		 367 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  26.81 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  27.14 
 
 		 318 aa  113  7.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  26.43 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  26.09 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  26.16 
 
 		 321 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  29.1 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  29.21 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  24.35 
 
 		 328 aa  100  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  25.28 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.15 
 
 		 372 aa  92.8  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1962  peptidylglycine monooxygenase-like  24.1 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  25 
 
 		 284 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  26.79 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  32.54 
 
 		 211 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  27.65 
 
 		 279 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  25.73 
 
 		 387 aa  54.3  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  31.25 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.35 
 
 		 930 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  29.93 
 
 		 353 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  24.26 
 
 		 831 aa  49.7  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  30.23 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  25.73 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  25 
 
 		 709 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.23 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  29.73 
 
 		 588 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3780  hypothetical protein  24.93 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_15206  peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase-like protein  35.14 
 
 		 774 aa  47.4  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.002705  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  24.88 
 
 		 522 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  26.09 
 
 		 1293 aa  47  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  27.71 
 
 		 418 aa  46.6  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  27.59 
 
 		 627 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  23.7 
 
 		 668 aa  46.6  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  25.73 
 
 		 491 aa  45.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  25 
 
 		 392 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  24.72 
 
 		 930 aa  45.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  25.68 
 
 		 395 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.17 
 
 		 1292 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  27.33 
 
 		 1068 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0535  NHL repeat-containing protein  28.47 
 
 		 642 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000386483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  27.91 
 
 		 676 aa  43.9  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  23.46 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  20.78 
 
 		 525 aa  43.1  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>