37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1260 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  100 
 
 		 372 aa  775    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1962  peptidylglycine monooxygenase-like  65.24 
 
 		 375 aa  490  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  58.89 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  39.83 
 
 		 353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  36.73 
 
 		 367 aa  230  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  26.15 
 
 		 371 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  24.93 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  27.14 
 
 		 328 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  26.43 
 
 		 320 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  25.69 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  26.19 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  26.11 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  24.71 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  24.78 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.22 
 
 		 668 aa  63.2  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  23.96 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  27.7 
 
 		 709 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  26.92 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  25.59 
 
 		 930 aa  57  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 522 aa  56.2  0.0000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  23.19 
 
 		 627 aa  53.9  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  23.75 
 
 		 579 aa  53.5  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  23.57 
 
 		 1293 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  24.15 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  34.29 
 
 		 660 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  32.04 
 
 		 279 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  29.89 
 
 		 364 aa  48.1  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  23.21 
 
 		 676 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  31.31 
 
 		 211 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  22.89 
 
 		 831 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  27.68 
 
 		 346 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  25.99 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  25.23 
 
 		 1030 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  23.99 
 
 		 892 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  26.59 
 
 		 1068 aa  43.5  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  32.58 
 
 		 418 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  19.23 
 
 		 588 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>