55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4420 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4420  NHL repeat containing protein  100 
 
 
320 aa  626  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1954  NHL repeat containing protein  55.69 
 
 
340 aa  314  9.999999999999999e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2067  NHL repeat containing protein  29.1 
 
 
371 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.43 
 
 
372 aa  91.3  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  25.25 
 
 
367 aa  88.6  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  24.56 
 
 
353 aa  84  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1962  peptidylglycine monooxygenase-like  25.61 
 
 
375 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  27.52 
 
 
328 aa  79.7  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  32.27 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  27.94 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  29.82 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  32.47 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4750  NHL repeat-containing protein  30.12 
 
 
279 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.869111  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  31.01 
 
 
284 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  30.43 
 
 
579 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  30.33 
 
 
318 aa  63.5  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  34.38 
 
 
211 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3219  hypothetical protein  26.2 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116128  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  26.84 
 
 
668 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  25.82 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.19 
 
 
930 aa  56.2  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  25.74 
 
 
831 aa  55.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.81 
 
 
693 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  27.21 
 
 
627 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  25.4 
 
 
346 aa  53.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  25.34 
 
 
676 aa  52.8  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  24.11 
 
 
709 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.05 
 
 
343 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  26.67 
 
 
700 aa  50.8  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  23.69 
 
 
396 aa  50.4  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  26.63 
 
 
588 aa  49.7  0.00007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  31.08 
 
 
343 aa  49.3  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  30.88 
 
 
364 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  25.74 
 
 
343 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  35.38 
 
 
491 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  25.34 
 
 
930 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  26.17 
 
 
522 aa  47.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  24.73 
 
 
525 aa  47  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  26.29 
 
 
307 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  27.01 
 
 
850 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  25.97 
 
 
354 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  25.27 
 
 
391 aa  44.3  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  25.9 
 
 
963 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  22.58 
 
 
392 aa  43.9  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  35.79 
 
 
395 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  28.78 
 
 
652 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  28.65 
 
 
319 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  26.15 
 
 
353 aa  43.5  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  27.48 
 
 
365 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  28.28 
 
 
355 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  29.31 
 
 
903 aa  42.4  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  28.64 
 
 
439 aa  42.4  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  23.86 
 
 
752 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  28.3 
 
 
1026 aa  42.4  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>