57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1988 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1115  hypothetical protein  41.5 
 
 		 317 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  39.47 
 
 		 315 aa  226  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3163  NHL repeat domain protein  40.49 
 
 		 313 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3258  NHL repeat domain protein  41.01 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3065  NHL repeat-containing protein  41.07 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1839  NHL repeat-containing protein  30.87 
 
 		 304 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.891916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  35.26 
 
 		 347 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.59 
 
 		 365 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  28.57 
 
 		 676 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  25.61 
 
 		 930 aa  61.2  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  22.22 
 
 		 752 aa  60.1  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  26.46 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 363 aa  57.4  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  28.82 
 
 		 384 aa  55.8  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  24.07 
 
 		 668 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  29.68 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  31.5 
 
 		 373 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  22.96 
 
 		 326 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  26.45 
 
 		 588 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  23.29 
 
 		 322 aa  53.9  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  27.88 
 
 		 343 aa  53.9  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  26.06 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  22.86 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  28.27 
 
 		 372 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  33.72 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  27.75 
 
 		 355 aa  50.4  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  36.71 
 
 		 323 aa  50.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  31.03 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  22.66 
 
 		 627 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  22.92 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  32.56 
 
 		 522 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.22 
 
 		 343 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  25.79 
 
 		 1146 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  26.15 
 
 		 353 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  27.41 
 
 		 1140 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  26.83 
 
 		 700 aa  47  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  24.7 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  26.61 
 
 		 660 aa  46.6  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  22.65 
 
 		 346 aa  46.6  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2816  NHL repeat-containing protein  42.65 
 
 		 386 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  26.52 
 
 		 899 aa  46.6  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  22.77 
 
 		 491 aa  46.2  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  28.66 
 
 		 396 aa  46.2  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  20.86 
 
 		 318 aa  46.2  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  28.89 
 
 		 1293 aa  45.8  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  22.84 
 
 		 1163 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  20 
 
 		 831 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  32.94 
 
 		 898 aa  45.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  26.42 
 
 		 1068 aa  44.7  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  26.72 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  25.58 
 
 		 387 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  27.56 
 
 		 355 aa  43.1  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  31.4 
 
 		 579 aa  42.7  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  25.4 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  33.82 
 
 		 368 aa  42.7  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  33.33 
 
 		 525 aa  42.4  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>