25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_3163 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_3163  NHL repeat domain protein  100 
 
 
313 aa  607  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3258  NHL repeat domain protein  90.1 
 
 
313 aa  554  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3065  NHL repeat-containing protein  87.1 
 
 
316 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  40.49 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1839  NHL repeat-containing protein  38.78 
 
 
304 aa  170  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.891916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  38.06 
 
 
315 aa  169  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1115  hypothetical protein  31.21 
 
 
317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  25.75 
 
 
343 aa  56.6  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  29.03 
 
 
347 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  27.69 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  28.4 
 
 
368 aa  49.7  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  30.54 
 
 
343 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  30 
 
 
373 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  24.21 
 
 
1293 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  31.34 
 
 
322 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  29.31 
 
 
363 aa  46.2  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  46.3 
 
 
323 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  25.35 
 
 
930 aa  45.8  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  25.44 
 
 
361 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  27.12 
 
 
360 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  30.89 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  27.74 
 
 
379 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  24.72 
 
 
831 aa  43.5  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  26.45 
 
 
353 aa  42.7  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  28.57 
 
 
1146 aa  42.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>