29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3065 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3065  NHL repeat-containing protein  100 
 
 		 316 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3163  NHL repeat domain protein  87.1 
 
 		 313 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3258  NHL repeat domain protein  84.52 
 
 		 313 aa  514  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  41.07 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1839  NHL repeat-containing protein  37.97 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.891916 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2505  NHL repeat-containing protein  38.52 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.990992  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1115  hypothetical protein  32.16 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581052  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.24 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  25.39 
 
 		 347 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  28.24 
 
 		 326 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  21.53 
 
 		 752 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  29.34 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  22.3 
 
 		 363 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.91 
 
 		 930 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  24.9 
 
 		 1293 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  23.99 
 
 		 831 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  27.74 
 
 		 368 aa  47  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  30.33 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  25.58 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  33.73 
 
 		 379 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  25.62 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  24.71 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  28.99 
 
 		 373 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  24.85 
 
 		 361 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  28.92 
 
 		 1146 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  26.05 
 
 		 353 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  31.03 
 
 		 322 aa  42.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  28.89 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  25.62 
 
 		 372 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>