25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1671 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1064    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  39.64 
 
 		 533 aa  377  1e-103  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  24.33 
 
 		 332 aa  79.7  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  21.67 
 
 		 335 aa  67  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  24 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  23.97 
 
 		 927 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  23.83 
 
 		 368 aa  62  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  22.06 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  20.49 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  23.45 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  23.81 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  20.36 
 
 		 331 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  20.91 
 
 		 316 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  21.92 
 
 		 316 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  21.96 
 
 		 326 aa  55.5  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  20.36 
 
 		 294 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  19.51 
 
 		 349 aa  53.9  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  22.92 
 
 		 290 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  20.27 
 
 		 299 aa  52.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  19.79 
 
 		 667 aa  50.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  23.45 
 
 		 392 aa  50.4  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  19.57 
 
 		 351 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  19.76 
 
 		 328 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  21.98 
 
 		 343 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  22.22 
 
 		 416 aa  43.9  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>