80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1990 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  100 
 
 		 326 aa  651    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  54.49 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  53.31 
 
 		 332 aa  348  6e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  55.12 
 
 		 368 aa  315  7e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  42.16 
 
 		 416 aa  236  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  33.92 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  31.54 
 
 		 335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  32.78 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  32.13 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  32.05 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  30.07 
 
 		 359 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  26.32 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  30.74 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  25.86 
 
 		 927 aa  91.3  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  29.49 
 
 		 294 aa  91.7  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  28.93 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  28.57 
 
 		 302 aa  86.7  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  28.76 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  27 
 
 		 392 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  29.13 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  27.73 
 
 		 280 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  27.31 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  27.31 
 
 		 280 aa  76.6  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  27.98 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  26.83 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  27.3 
 
 		 328 aa  70.5  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  24.78 
 
 		 657 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  24.48 
 
 		 667 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  24.78 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  24.78 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  24.78 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  24.78 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  24.78 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  24.48 
 
 		 657 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  24 
 
 		 524 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  31.54 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2413  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.4 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.992934 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.64 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  23.94 
 
 		 533 aa  54.3  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  24.41 
 
 		 1278 aa  53.9  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.51 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  24.89 
 
 		 1608 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  21.53 
 
 		 668 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0008  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.51 
 
 		 328 aa  49.3  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3772  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.25 
 
 		 406 aa  49.7  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0721  putative signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 989 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0872972  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5077  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1009 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.101156  normal  0.100954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1892  hypothetical protein  22.45 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.65 
 
 		 553 aa  47.8  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  20.4 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  26.8 
 
 		 457 aa  47.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1279  hypothetical protein  25.1 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  33.33 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  20.35 
 
 		 1557 aa  45.4  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2396  hypothetical protein  25.63 
 
 		 616 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000510296 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  22.55 
 
 		 1093 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0604  hypothetical protein  26.47 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  23.85 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  24.59 
 
 		 1054 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1260  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.5 
 
 		 345 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0351  hypothetical protein  22.78 
 
 		 653 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  34.18 
 
 		 1313 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0020  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.92 
 
 		 521 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  22.19 
 
 		 1327 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2667  histidine kinase  27.48 
 
 		 1017 aa  44.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.865327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  25.57 
 
 		 1182 aa  44.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  33.98 
 
 		 921 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  26.81 
 
 		 1278 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0025  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25.55 
 
 		 522 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.932986 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  18.75 
 
 		 676 aa  43.9  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0368  Ricin B lectin  29.08 
 
 		 1577 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.18771  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  58.33 
 
 		 1347 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07650  YVTN family beta-propeller repeat protein  26.39 
 
 		 461 aa  43.5  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.446575  normal  0.383587 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0341  sensory box protein  30.71 
 
 		 1515 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4824  histidine kinase  27.27 
 
 		 1024 aa  43.1  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0714049  normal  0.112759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  26 
 
 		 364 aa  42.7  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3037  hypothetical protein  25.49 
 
 		 433 aa  42.7  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.701373 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  22.74 
 
 		 950 aa  42.7  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8646  NHL repeat containing protein  31.48 
 
 		 658 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  25 
 
 		 1342 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>