46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1421 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  100 
 
 		 332 aa  666    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  52.16 
 
 		 326 aa  349  4e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  49.66 
 
 		 326 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  49.67 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  37.89 
 
 		 416 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  28.88 
 
 		 335 aa  139  6e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.67 
 
 		 351 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  33.56 
 
 		 349 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  31.06 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  31.23 
 
 		 359 aa  96.3  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  27.3 
 
 		 296 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  29.58 
 
 		 302 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  28.39 
 
 		 927 aa  87.4  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  29.18 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  29.63 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  25.85 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  30.08 
 
 		 299 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  24.33 
 
 		 524 aa  79.7  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  28.57 
 
 		 316 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  27.84 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  28.85 
 
 		 328 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  29.06 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  26.14 
 
 		 657 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  23.17 
 
 		 392 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  28.21 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  26.14 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  26.14 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  28.21 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  26.14 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  26.14 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  26.14 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  26.14 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  26.57 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  23.7 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  25.38 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  31.65 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1052  hypothetical protein  30.48 
 
 		 827 aa  47.4  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.255534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.36 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1940  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.73 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  29.29 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3038  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  25 
 
 		 332 aa  44.3  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2068  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.57 
 
 		 328 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1685  GGDEF domain-containing protein  23.48 
 
 		 987 aa  43.1  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00461565  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  22.78 
 
 		 1949 aa  42.7  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2396  hypothetical protein  26.67 
 
 		 616 aa  42.7  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000510296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>