73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5477 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  100 
 
 		 351 aa  709    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_003296  RS02985  putative hydrolase transmembrane protein  83.28 
 
 		 349 aa  545  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  65.74 
 
 		 331 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2738  twin-arginine translocation pathway signal  50.91 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.21554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06130  hypothetical protein  39.31 
 
 		 316 aa  212  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.772958  decreased coverage  0.00656931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0574  hypothetical protein  39.31 
 
 		 316 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.30321  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0277  streptogramin lyase  30 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0306728  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1990  streptogramin lyase  32.78 
 
 		 326 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.573521  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1989  streptogramin lyase gluconolactonase family  33.1 
 
 		 368 aa  127  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1421  streptogramin lyase  34.85 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1431  lyase precursor-like  27.33 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00000675912  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1192  hypothetical protein  31.11 
 
 		 667 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.251244  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1728  hypothetical protein  31.11 
 
 		 657 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0868275  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0222  hypothetical protein  31.11 
 
 		 657 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1063  hypothetical protein  31.11 
 
 		 657 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1220  hypothetical protein  31.11 
 
 		 657 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.124677  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0365  hypothetical protein  31.11 
 
 		 657 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.860395  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0053  hypothetical protein  31.11 
 
 		 657 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1639  hypothetical protein  31.11 
 
 		 657 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0248  putative hydrolase transmembrane protein  24.84 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1558  hydrolase  31.32 
 
 		 294 aa  91.3  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.530388  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3858  hydrolase  32.3 
 
 		 280 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3932  hydrolase  32.3 
 
 		 280 aa  89.7  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2867  putative hydrolase  31.27 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.618426  normal  0.632922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3844  hydrolase  31.91 
 
 		 280 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0281491 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7528  putative hydrolase  28.16 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0701263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  26.69 
 
 		 328 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1898  putative hydrolase  30.38 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.305143 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3276  lyase-like protein  26.35 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1889  hydrolase  27.84 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3155  putative antibiotic hydrolase signal peptide protein  24.34 
 
 		 392 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1749  hypothetical protein  25.21 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000980915  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  23.46 
 
 		 927 aa  71.6  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  28.47 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1199  hypothetical protein  20.68 
 
 		 533 aa  59.7  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0604  hypothetical protein  27.05 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  27.91 
 
 		 1093 aa  54.3  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  25.84 
 
 		 1086 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2607  GGDEF domain-containing protein  24.15 
 
 		 1054 aa  50.1  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.202674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  23.64 
 
 		 1378 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2189  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.05 
 
 		 348 aa  49.3  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1671  hypothetical protein  19.57 
 
 		 524 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.17 
 
 		 526 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.222131 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01692  histidine kinase-response regulator hybrid protein  25 
 
 		 921 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.803557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1720  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  24.42 
 
 		 1949 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  28.48 
 
 		 457 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4743  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  23.16 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  28.23 
 
 		 680 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  21.4 
 
 		 1608 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  22.76 
 
 		 1363 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  24.34 
 
 		 1093 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0536  histidine kinase  21.68 
 
 		 1324 aa  46.6  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0692259  normal  0.421547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5817  hypothetical protein  31.25 
 
 		 272 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.760782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2396  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  30.46 
 
 		 275 aa  46.6  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000818527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1335  histidine kinase  26.49 
 
 		 1278 aa  46.2  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820531 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  28.32 
 
 		 214 aa  46.2  0.0009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3543  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.23 
 
 		 1498 aa  45.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.476146  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4548  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.41 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1331  sensor histidine kinase/response regulator  23.26 
 
 		 1118 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4633  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.88 
 
 		 335 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1471  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  25.83 
 
 		 348 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0448  histidine kinase  23.42 
 
 		 1114 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.823175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2750  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.25 
 
 		 280 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  25.31 
 
 		 556 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2140  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 1211 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.382987 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  26.83 
 
 		 354 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2318  histidine kinase  24.84 
 
 		 1298 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2800  NHL repeat-containing protein  29.65 
 
 		 538 aa  43.5  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350365  normal  0.74213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2136  putative gluconolactonase  28.64 
 
 		 293 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2454  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.37 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0662478 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4495  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  29.32 
 
 		 538 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.789599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  30.93 
 
 		 529 aa  42.7  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4408  NHL repeat-containing protein  29.32 
 
 		 538 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>