52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1375 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  435  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  98.6 
 
 		 214 aa  430  1e-120  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  79.91 
 
 		 216 aa  359  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  78.1 
 
 		 210 aa  345  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  77.14 
 
 		 210 aa  342  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  76.17 
 
 		 214 aa  342  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  75.83 
 
 		 228 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  76.56 
 
 		 228 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  76.56 
 
 		 228 aa  339  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  73.24 
 
 		 226 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  75.47 
 
 		 227 aa  338  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  76.56 
 
 		 227 aa  338  5e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  75.7 
 
 		 227 aa  337  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  75.7 
 
 		 227 aa  337  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  75.7 
 
 		 227 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  75.7 
 
 		 227 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  75.7 
 
 		 227 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  75.7 
 
 		 227 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  73.24 
 
 		 225 aa  332  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  75.73 
 
 		 228 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  72.64 
 
 		 213 aa  326  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  72.51 
 
 		 212 aa  324  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  72.04 
 
 		 223 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  71.23 
 
 		 212 aa  317  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  68.57 
 
 		 214 aa  307  6.999999999999999e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  69.05 
 
 		 227 aa  307  8e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  66.2 
 
 		 213 aa  306  1.0000000000000001e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  70.05 
 
 		 220 aa  302  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  68.57 
 
 		 222 aa  300  9e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  73.21 
 
 		 210 aa  300  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2670  hypothetical protein  72.73 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2359  hypothetical protein  71.96 
 
 		 218 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  65.89 
 
 		 213 aa  289  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  71.03 
 
 		 228 aa  289  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  68.66 
 
 		 245 aa  283  9e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  67.94 
 
 		 210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  65.69 
 
 		 248 aa  268  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  64.56 
 
 		 248 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  63.73 
 
 		 244 aa  261  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2408  streptogramin lyase  78.29 
 
 		 152 aa  209  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  27.08 
 
 		 386 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2195  hypothetical protein  26.94 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  26.06 
 
 		 256 aa  46.2  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5477  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.32 
 
 		 351 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.521709 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  29.52 
 
 		 3041 aa  45.1  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5761  glutamine cyclotransferase  26.73 
 
 		 256 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.24 
 
 		 553 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  36.14 
 
 		 359 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0625  hypothetical protein  25.19 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.578108  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0141  lyase-like protein  27.54 
 
 		 328 aa  42.7  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0847  hypothetical protein  25.62 
 
 		 256 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3680  putative hydrolase transmembrane protein  28.65 
 
 		 331 aa  41.2  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.592047  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>