45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_2461 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  100 
 
 
227 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  99.12 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  99.12 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  99.12 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  99.12 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  99.12 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  90.35 
 
 
228 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  78.6 
 
 
228 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  75.44 
 
 
226 aa  352  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  78.14 
 
 
228 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  78.14 
 
 
228 aa  352  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  77.67 
 
 
225 aa  352  4e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  77.57 
 
 
216 aa  351  7e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  79.62 
 
 
227 aa  349  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  78.5 
 
 
214 aa  349  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  79.9 
 
 
210 aa  347  6e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  79.43 
 
 
227 aa  346  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  79.9 
 
 
210 aa  345  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  75.7 
 
 
214 aa  337  7e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  74.77 
 
 
214 aa  333  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  74.29 
 
 
223 aa  328  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  75.12 
 
 
213 aa  324  8.000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  71.23 
 
 
212 aa  316  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  70.14 
 
 
212 aa  316  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  72.17 
 
 
214 aa  314  7e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  73.68 
 
 
222 aa  308  5e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  75 
 
 
228 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2670  hypothetical protein  76.3 
 
 
218 aa  305  3e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  75.6 
 
 
210 aa  304  6e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  68.08 
 
 
213 aa  301  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  69.86 
 
 
213 aa  300  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  71.71 
 
 
227 aa  297  7e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  70.87 
 
 
220 aa  297  7e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2359  hypothetical protein  71.23 
 
 
218 aa  296  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137558  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  71.14 
 
 
245 aa  290  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  70.48 
 
 
210 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2408  streptogramin lyase  96.5 
 
 
152 aa  275  4e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  68.14 
 
 
244 aa  269  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  67.15 
 
 
248 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  68.29 
 
 
248 aa  268  4e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0588  transglutaminase domain protein  24.78 
 
 
574 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.618146  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0847  hypothetical protein  25.83 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  30.33 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.14 
 
 
553 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  27.42 
 
 
359 aa  42.4  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>