48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3152 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  426  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  76.44 
 
 		 213 aa  318  3.9999999999999996e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  70.7 
 
 		 216 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  74.88 
 
 		 214 aa  312  1.9999999999999998e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  72.12 
 
 		 214 aa  308  5.9999999999999995e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  70.87 
 
 		 210 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  69.86 
 
 		 227 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  69.86 
 
 		 227 aa  300  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  69.86 
 
 		 227 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  69.86 
 
 		 227 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  69.86 
 
 		 227 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  69.86 
 
 		 227 aa  299  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  70.1 
 
 		 228 aa  297  7e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  67.46 
 
 		 225 aa  295  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  68.57 
 
 		 228 aa  295  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  66.2 
 
 		 223 aa  295  4e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  68.75 
 
 		 228 aa  293  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  68.75 
 
 		 228 aa  293  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  68.75 
 
 		 210 aa  293  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  69.05 
 
 		 227 aa  293  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  66.67 
 
 		 226 aa  292  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  69.23 
 
 		 227 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  65.89 
 
 		 214 aa  289  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  67.49 
 
 		 212 aa  287  9e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2359  hypothetical protein  70.39 
 
 		 218 aa  286  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137558  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  64.95 
 
 		 214 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  72.95 
 
 		 210 aa  284  8e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2670  hypothetical protein  71.15 
 
 		 218 aa  280  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  69.9 
 
 		 210 aa  278  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  68.53 
 
 		 245 aa  276  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  64.76 
 
 		 212 aa  277  1e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  65.85 
 
 		 222 aa  271  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  64.42 
 
 		 213 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  64.25 
 
 		 220 aa  267  8e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  65.57 
 
 		 228 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  62.93 
 
 		 227 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  65.37 
 
 		 248 aa  254  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  65.37 
 
 		 248 aa  254  9e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  63.55 
 
 		 244 aa  250  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2408  streptogramin lyase  72.58 
 
 		 152 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  29.71 
 
 		 386 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2182  hypothetical protein  30.77 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0541335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  26.07 
 
 		 359 aa  48.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2195  hypothetical protein  27.23 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  30.28 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0604  hypothetical protein  27.19 
 
 		 310 aa  45.8  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10783  Glutamine cyclotransferase  29.6 
 
 		 348 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5761  glutamine cyclotransferase  29.35 
 
 		 256 aa  41.6  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.0887235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>