46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4850 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  414  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  73.68 
 
 		 216 aa  331  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  72.86 
 
 		 225 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  72.86 
 
 		 228 aa  318  5e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  72.73 
 
 		 228 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  72.73 
 
 		 228 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  71.29 
 
 		 210 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  70.95 
 
 		 226 aa  315  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  72.25 
 
 		 213 aa  315  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  71.9 
 
 		 227 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  70.19 
 
 		 214 aa  311  5.999999999999999e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  71.77 
 
 		 227 aa  310  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  69.38 
 
 		 210 aa  310  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  71.36 
 
 		 228 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  70.33 
 
 		 214 aa  307  8e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  72.95 
 
 		 213 aa  306  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  70.48 
 
 		 227 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  67.46 
 
 		 212 aa  306  1.0000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  70 
 
 		 227 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  70 
 
 		 227 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  70 
 
 		 227 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  67.94 
 
 		 214 aa  302  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  70 
 
 		 227 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  70 
 
 		 227 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  66.99 
 
 		 214 aa  298  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  67.14 
 
 		 212 aa  293  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  66.99 
 
 		 223 aa  291  5e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  67.46 
 
 		 222 aa  281  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  68.42 
 
 		 210 aa  277  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2670  hypothetical protein  68.57 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2359  hypothetical protein  68.4 
 
 		 218 aa  276  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  63.77 
 
 		 227 aa  274  7e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  64.11 
 
 		 213 aa  273  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  67.94 
 
 		 228 aa  270  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  64.08 
 
 		 220 aa  269  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  65.48 
 
 		 245 aa  265  4e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  61.76 
 
 		 244 aa  249  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  62.14 
 
 		 248 aa  248  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  61.95 
 
 		 248 aa  246  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2408  streptogramin lyase  73.81 
 
 		 152 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  27.22 
 
 		 386 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  29.13 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4080  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1124 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292091  normal  0.032057 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1647  hypothetical protein  31.48 
 
 		 1124 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2195  hypothetical protein  31.25 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0847  hypothetical protein  25.62 
 
 		 256 aa  41.6  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00187018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>