51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5693 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  73.46 
 
 		 227 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  73.46 
 
 		 225 aa  324  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  70.75 
 
 		 216 aa  323  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  73.46 
 
 		 228 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  72.25 
 
 		 210 aa  322  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  73.21 
 
 		 227 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  72.51 
 
 		 226 aa  322  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  72.99 
 
 		 228 aa  321  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  72.99 
 
 		 228 aa  321  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  71.77 
 
 		 210 aa  318  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  71.23 
 
 		 214 aa  317  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  71.23 
 
 		 227 aa  316  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  70.75 
 
 		 214 aa  314  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  70.14 
 
 		 214 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  70.28 
 
 		 227 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  70.28 
 
 		 227 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  70.28 
 
 		 227 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  70.28 
 
 		 227 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  70.28 
 
 		 227 aa  310  7.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  71.84 
 
 		 228 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  66.35 
 
 		 212 aa  301  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  68.42 
 
 		 213 aa  298  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  64.9 
 
 		 214 aa  286  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  64.45 
 
 		 223 aa  285  4e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  70.75 
 
 		 228 aa  282  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  63.03 
 
 		 213 aa  281  6.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  67.94 
 
 		 210 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  63.64 
 
 		 222 aa  277  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  64.76 
 
 		 213 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2670  hypothetical protein  66.82 
 
 		 218 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  63.29 
 
 		 220 aa  275  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  62.44 
 
 		 227 aa  275  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  67.14 
 
 		 210 aa  275  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  65.48 
 
 		 245 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2359  hypothetical protein  64.15 
 
 		 218 aa  260  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  60.39 
 
 		 248 aa  258  6e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  60.49 
 
 		 248 aa  255  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  59.51 
 
 		 244 aa  253  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2408  streptogramin lyase  74.22 
 
 		 152 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0847  hypothetical protein  31.4 
 
 		 256 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  27.15 
 
 		 1898 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00869  glutamine cyclotransferase  36.67 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.268482  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  36.49 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0604  hypothetical protein  26.67 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  25.86 
 
 		 386 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2182  hypothetical protein  30.28 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0541335 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  34.41 
 
 		 359 aa  42.7  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  27.78 
 
 		 3041 aa  42.4  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.53 
 
 		 553 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.25 
 
 		 415 aa  41.6  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>