48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2340 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2670  hypothetical protein  95.22 
 
 
218 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  77.62 
 
 
214 aa  349  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  76.08 
 
 
210 aa  340  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  74.64 
 
 
216 aa  337  8e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  76.08 
 
 
210 aa  337  9e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  75.12 
 
 
213 aa  334  3.9999999999999995e-91  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  74.16 
 
 
227 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  74.16 
 
 
227 aa  332  3e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  75.6 
 
 
227 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  75.6 
 
 
227 aa  328  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  73.21 
 
 
225 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  73.68 
 
 
228 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  73.68 
 
 
228 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  73.68 
 
 
228 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  72.25 
 
 
226 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  74.04 
 
 
214 aa  327  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  75.6 
 
 
227 aa  327  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  75.6 
 
 
227 aa  327  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  75.6 
 
 
227 aa  327  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  75.6 
 
 
227 aa  327  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  75.73 
 
 
228 aa  324  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  73.21 
 
 
214 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  73.68 
 
 
214 aa  323  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  67.46 
 
 
212 aa  308  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  71.57 
 
 
220 aa  304  6e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  69.9 
 
 
213 aa  302  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  69.86 
 
 
222 aa  301  6.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  67.46 
 
 
223 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  67.94 
 
 
212 aa  298  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  66.99 
 
 
213 aa  296  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  66.67 
 
 
227 aa  296  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  69.65 
 
 
245 aa  291  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  71.77 
 
 
228 aa  290  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2359  hypothetical protein  69.81 
 
 
218 aa  288  3e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137558  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  68.1 
 
 
210 aa  282  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  61.72 
 
 
248 aa  262  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  62.44 
 
 
244 aa  260  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  62.25 
 
 
248 aa  258  4e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2408  streptogramin lyase  76.8 
 
 
152 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  26.99 
 
 
386 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  29.6 
 
 
359 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2094  hypothetical protein  24.73 
 
 
343 aa  46.2  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.327538  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4436  hypothetical protein  24.57 
 
 
322 aa  45.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0659418  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3145  glutamine cyclotransferase  30.87 
 
 
276 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2195  hypothetical protein  25.96 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202937  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0604  hypothetical protein  24.71 
 
 
310 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0847  hypothetical protein  28 
 
 
256 aa  42.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00187018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>