47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6461 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  100 
 
 		 213 aa  427  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  68.72 
 
 		 214 aa  309  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  66.2 
 
 		 216 aa  308  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  66.2 
 
 		 214 aa  306  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  68.57 
 
 		 210 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  69.19 
 
 		 223 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  65.26 
 
 		 214 aa  302  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  67.14 
 
 		 210 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  65.89 
 
 		 226 aa  301  5.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  68.08 
 
 		 227 aa  301  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  68.08 
 
 		 227 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  66.82 
 
 		 227 aa  301  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  68.08 
 
 		 227 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  68.08 
 
 		 227 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  68.08 
 
 		 227 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  68.08 
 
 		 227 aa  300  9e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  66.82 
 
 		 213 aa  300  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  67.3 
 
 		 228 aa  299  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  65.73 
 
 		 225 aa  299  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  67.3 
 
 		 228 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  67.3 
 
 		 228 aa  299  3e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  66.99 
 
 		 227 aa  298  4e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  69.76 
 
 		 222 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  66.19 
 
 		 214 aa  295  3e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  67.96 
 
 		 228 aa  295  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  71.14 
 
 		 245 aa  292  3e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  67.8 
 
 		 227 aa  290  9e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  61.61 
 
 		 212 aa  286  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  63.03 
 
 		 212 aa  281  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  65.07 
 
 		 220 aa  279  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  66.99 
 
 		 210 aa  274  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  64.42 
 
 		 213 aa  271  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2670  hypothetical protein  67.46 
 
 		 218 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  66.51 
 
 		 228 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2359  hypothetical protein  61.68 
 
 		 218 aa  260  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  64.11 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  60.48 
 
 		 248 aa  256  3e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  60 
 
 		 248 aa  254  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  59.62 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2408  streptogramin lyase  72.66 
 
 		 152 aa  194  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0504  hypothetical protein  25.41 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000894372  hitchhiker  0.00102967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4041  glutamine cyclotransferase  25.41 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.66417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0172  glutamine cyclotransferase  25.41 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0847  hypothetical protein  26.23 
 
 		 256 aa  43.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00187018  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  27.78 
 
 		 553 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  35.53 
 
 		 386 aa  41.6  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  35.53 
 
 		 359 aa  41.6  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>