49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2359 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_2359  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137558  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  75.23 
 
 
216 aa  333  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  73.71 
 
 
210 aa  324  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  73.11 
 
 
214 aa  320  9.000000000000001e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  72.77 
 
 
210 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  71.63 
 
 
213 aa  316  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  69.44 
 
 
228 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  69.44 
 
 
228 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  69.44 
 
 
228 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  71.96 
 
 
214 aa  313  9e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  68.37 
 
 
225 aa  311  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  71.5 
 
 
214 aa  311  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  71.23 
 
 
227 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  71.23 
 
 
227 aa  310  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  71.23 
 
 
227 aa  309  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  71.23 
 
 
227 aa  309  2e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  71.23 
 
 
227 aa  309  2e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  71.23 
 
 
227 aa  309  2e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  68.87 
 
 
226 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  68.69 
 
 
214 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  70.81 
 
 
228 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  67.44 
 
 
227 aa  302  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  68.4 
 
 
227 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  70.39 
 
 
213 aa  298  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  66.82 
 
 
212 aa  299  3e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  65.89 
 
 
223 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  70.33 
 
 
220 aa  292  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  67.14 
 
 
222 aa  292  3e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  65.75 
 
 
227 aa  290  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  70.75 
 
 
228 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  69.81 
 
 
210 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  64.15 
 
 
212 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2670  hypothetical protein  69.12 
 
 
218 aa  278  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  61.68 
 
 
213 aa  275  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  66.67 
 
 
245 aa  275  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  68.4 
 
 
210 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  65.7 
 
 
244 aa  268  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  64.15 
 
 
248 aa  264  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  65.22 
 
 
248 aa  261  4.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2408  streptogramin lyase  70.8 
 
 
152 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  29.12 
 
 
386 aa  50.1  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  25.14 
 
 
359 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2195  hypothetical protein  31.82 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202937  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  28.68 
 
 
264 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5761  glutamine cyclotransferase  26.13 
 
 
256 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2371  hypothetical protein  28.28 
 
 
674 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0847  hypothetical protein  24.81 
 
 
256 aa  42.4  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00187018  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1065  glutamine cyclotransferase  24.77 
 
 
257 aa  41.6  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0604  hypothetical protein  25.86 
 
 
310 aa  41.6  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>