36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2930 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  100 
 
 
264 aa  532  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2900  glutamine cyclotransferase  97.35 
 
 
264 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2944  glutamine cyclotransferase  97.35 
 
 
264 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1065  glutamine cyclotransferase  56.08 
 
 
257 aa  290  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5761  glutamine cyclotransferase  59.72 
 
 
256 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3145  glutamine cyclotransferase  52.36 
 
 
276 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0484  glutamine cyclotransferase  53.85 
 
 
259 aa  251  7e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34010  glutamine cyclotransferase  48.91 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.334448  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4041  glutamine cyclotransferase  38.82 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.66417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0172  glutamine cyclotransferase  38.82 
 
 
263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0504  hypothetical protein  38.82 
 
 
263 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000894372  hitchhiker  0.00102967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3371  glutamine cyclotransferase  40.64 
 
 
279 aa  169  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  38.7 
 
 
256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0451  glutamine cyclotransferase  43.64 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267078  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1974  glutamine cyclotransferase  36.97 
 
 
349 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.424232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2500  glutamine cyclotransferase  41.85 
 
 
253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1300  glutamine cyclotransferase  38.19 
 
 
274 aa  161  9e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2462  glutamine cyclotransferase  37.14 
 
 
262 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704025  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0278  glutamine cyclotransferase  36.84 
 
 
364 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.286822  normal 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6727  glutamine cyclotransferase  38.43 
 
 
362 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.740303 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10783  Glutamine cyclotransferase  35.19 
 
 
348 aa  155  8e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0828  glutamine cyclotransferase  35.84 
 
 
272 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1498  glutamine cyclotransferase  40.91 
 
 
256 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00869  glutamine cyclotransferase  37.78 
 
 
272 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.268482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4569  glutamine cyclotransferase  33.93 
 
 
349 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20936  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50239  predicted protein  36.8 
 
 
377 aa  147  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1469  glutamine cyclotransferase-like  32.02 
 
 
284 aa  141  9e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1326  glutamine cyclotransferase  35.71 
 
 
263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.211339  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2647  glutamine cyclotransferase  37.77 
 
 
330 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1980  glutamine cyclotransferase  39.15 
 
 
289 aa  129  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44182  predicted protein  33.86 
 
 
613 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_6083  predicted protein  34.31 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734662  normal  0.474336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  33.33 
 
 
3041 aa  51.2  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  25.3 
 
 
216 aa  42.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  25.44 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  25.44 
 
 
227 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>