35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1065 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1065  glutamine cyclotransferase  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5761  glutamine cyclotransferase  72.83 
 
 
256 aa  358  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3145  glutamine cyclotransferase  57.68 
 
 
276 aa  292  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  56.08 
 
 
264 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2900  glutamine cyclotransferase  56.47 
 
 
264 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2944  glutamine cyclotransferase  56.47 
 
 
264 aa  287  1e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0484  glutamine cyclotransferase  62.45 
 
 
259 aa  275  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34010  glutamine cyclotransferase  49.22 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.334448  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  40.23 
 
 
256 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3371  glutamine cyclotransferase  43.67 
 
 
279 aa  183  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2462  glutamine cyclotransferase  42.06 
 
 
262 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704025  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0504  hypothetical protein  37.75 
 
 
263 aa  178  7e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000894372  hitchhiker  0.00102967 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1300  glutamine cyclotransferase  42.04 
 
 
274 aa  178  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4041  glutamine cyclotransferase  37.75 
 
 
263 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.66417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0172  glutamine cyclotransferase  37.75 
 
 
263 aa  178  8e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0828  glutamine cyclotransferase  40.27 
 
 
272 aa  177  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2500  glutamine cyclotransferase  42.98 
 
 
253 aa  176  4e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0451  glutamine cyclotransferase  40.32 
 
 
255 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267078  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0278  glutamine cyclotransferase  40.69 
 
 
364 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.286822  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1498  glutamine cyclotransferase  41.82 
 
 
256 aa  165  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00869  glutamine cyclotransferase  38.04 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.268482  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6727  glutamine cyclotransferase  40.09 
 
 
362 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.740303 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2647  glutamine cyclotransferase  39.71 
 
 
330 aa  160  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10783  Glutamine cyclotransferase  38.57 
 
 
348 aa  159  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4569  glutamine cyclotransferase  35.37 
 
 
349 aa  159  5e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20936  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1469  glutamine cyclotransferase-like  33.46 
 
 
284 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1974  glutamine cyclotransferase  38.79 
 
 
349 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.424232  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1326  glutamine cyclotransferase  38.52 
 
 
263 aa  153  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.211339  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50239  predicted protein  40.61 
 
 
377 aa  145  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1980  glutamine cyclotransferase  39.92 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44182  predicted protein  32.39 
 
 
613 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_6083  predicted protein  33.76 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734662  normal  0.474336 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  32.17 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  30.7 
 
 
248 aa  42.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  30.7 
 
 
248 aa  42  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>