32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0451 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0451  glutamine cyclotransferase  100 
 
 		 255 aa  520  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267078  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2500  glutamine cyclotransferase  50.43 
 
 		 253 aa  235  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  48.36 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2462  glutamine cyclotransferase  47.22 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704025  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1498  glutamine cyclotransferase  50.44 
 
 		 256 aa  221  9e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00869  glutamine cyclotransferase  47.81 
 
 		 272 aa  215  4e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.268482  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0828  glutamine cyclotransferase  44 
 
 		 272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3371  glutamine cyclotransferase  47.06 
 
 		 279 aa  209  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1300  glutamine cyclotransferase  47.73 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0504  hypothetical protein  40.23 
 
 		 263 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000894372  hitchhiker  0.00102967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4041  glutamine cyclotransferase  42.24 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.66417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0172  glutamine cyclotransferase  42.24 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0278  glutamine cyclotransferase  43.83 
 
 		 364 aa  193  3e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.286822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4569  glutamine cyclotransferase  41.15 
 
 		 349 aa  186  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0484  glutamine cyclotransferase  43.88 
 
 		 259 aa  185  6e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2647  glutamine cyclotransferase  43.09 
 
 		 330 aa  181  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3145  glutamine cyclotransferase  45 
 
 		 276 aa  181  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1326  glutamine cyclotransferase  42.73 
 
 		 263 aa  177  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.211339  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10783  Glutamine cyclotransferase  36.64 
 
 		 348 aa  176  3e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1065  glutamine cyclotransferase  41.43 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  42.17 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1980  glutamine cyclotransferase  40.08 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6727  glutamine cyclotransferase  39.65 
 
 		 362 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.740303 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2944  glutamine cyclotransferase  41.83 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2900  glutamine cyclotransferase  41.83 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5761  glutamine cyclotransferase  42.13 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1469  glutamine cyclotransferase-like  33.73 
 
 		 284 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34010  glutamine cyclotransferase  42.17 
 
 		 277 aa  151  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.334448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1974  glutamine cyclotransferase  36.4 
 
 		 349 aa  150  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.424232  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50239  predicted protein  37.93 
 
 		 377 aa  142  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44182  predicted protein  31.8 
 
 		 613 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_6083  predicted protein  33.62 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734662  normal  0.474336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>