32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34010 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_34010  glutamine cyclotransferase  100 
 
 		 277 aa  553  1e-156  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.334448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0484  glutamine cyclotransferase  61.44 
 
 		 259 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3145  glutamine cyclotransferase  55.73 
 
 		 276 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1065  glutamine cyclotransferase  49.22 
 
 		 257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5761  glutamine cyclotransferase  51.83 
 
 		 256 aa  205  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2900  glutamine cyclotransferase  46.69 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2944  glutamine cyclotransferase  46.69 
 
 		 264 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  48.91 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0828  glutamine cyclotransferase  44.44 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2462  glutamine cyclotransferase  43.82 
 
 		 262 aa  185  5e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704025  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1498  glutamine cyclotransferase  45.81 
 
 		 256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1300  glutamine cyclotransferase  42.64 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3371  glutamine cyclotransferase  45.58 
 
 		 279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2500  glutamine cyclotransferase  42.54 
 
 		 253 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  41.28 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00869  glutamine cyclotransferase  44.44 
 
 		 272 aa  167  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.268482  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6727  glutamine cyclotransferase  40 
 
 		 362 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.740303 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1980  glutamine cyclotransferase  44.58 
 
 		 289 aa  165  8e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0504  hypothetical protein  38.72 
 
 		 263 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000894372  hitchhiker  0.00102967 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0172  glutamine cyclotransferase  38.72 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4041  glutamine cyclotransferase  38.72 
 
 		 263 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.66417  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1974  glutamine cyclotransferase  38.14 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.424232  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1469  glutamine cyclotransferase-like  38.08 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2647  glutamine cyclotransferase  42.68 
 
 		 330 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0278  glutamine cyclotransferase  38.02 
 
 		 364 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.286822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4569  glutamine cyclotransferase  33.33 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20936  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10783  Glutamine cyclotransferase  37.18 
 
 		 348 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0451  glutamine cyclotransferase  41.92 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267078  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1326  glutamine cyclotransferase  39.07 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.211339  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50239  predicted protein  35.5 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44182  predicted protein  36.08 
 
 		 613 aa  126  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_6083  predicted protein  32.26 
 
 		 251 aa  95.1  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734662  normal  0.474336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>