51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1722 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  100 
 
 
256 aa  518  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2462  glutamine cyclotransferase  47.33 
 
 
262 aa  229  3e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704025  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1498  glutamine cyclotransferase  50.88 
 
 
256 aa  228  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00869  glutamine cyclotransferase  47.7 
 
 
272 aa  226  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.268482  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2647  glutamine cyclotransferase  45.39 
 
 
330 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0451  glutamine cyclotransferase  50 
 
 
255 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267078  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2500  glutamine cyclotransferase  49.55 
 
 
253 aa  220  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1300  glutamine cyclotransferase  47.62 
 
 
274 aa  217  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10783  Glutamine cyclotransferase  43.04 
 
 
348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0278  glutamine cyclotransferase  44.3 
 
 
364 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.286822  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0504  hypothetical protein  41.18 
 
 
263 aa  211  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000894372  hitchhiker  0.00102967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4041  glutamine cyclotransferase  41.18 
 
 
263 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.66417  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3371  glutamine cyclotransferase  50.23 
 
 
279 aa  210  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0172  glutamine cyclotransferase  41.18 
 
 
263 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3145  glutamine cyclotransferase  45.06 
 
 
276 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0484  glutamine cyclotransferase  44.87 
 
 
259 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0828  glutamine cyclotransferase  43.72 
 
 
272 aa  204  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4569  glutamine cyclotransferase  41.38 
 
 
349 aa  196  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1980  glutamine cyclotransferase  44.49 
 
 
289 aa  191  1e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1065  glutamine cyclotransferase  40.23 
 
 
257 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6727  glutamine cyclotransferase  39.04 
 
 
362 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.740303 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5761  glutamine cyclotransferase  42.01 
 
 
256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2944  glutamine cyclotransferase  39.08 
 
 
264 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2900  glutamine cyclotransferase  39.08 
 
 
264 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  38.7 
 
 
264 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34010  glutamine cyclotransferase  41.28 
 
 
277 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.334448  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1469  glutamine cyclotransferase-like  33.6 
 
 
284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1326  glutamine cyclotransferase  36.44 
 
 
263 aa  159  3e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.211339  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1974  glutamine cyclotransferase  33.9 
 
 
349 aa  148  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.424232  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50239  predicted protein  36.8 
 
 
377 aa  143  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_6083  predicted protein  36.17 
 
 
251 aa  132  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734662  normal  0.474336 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44182  predicted protein  32.55 
 
 
613 aa  115  6e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  28.06 
 
 
222 aa  50.1  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  28.95 
 
 
220 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  30.28 
 
 
213 aa  46.6  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  26.06 
 
 
214 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  26.06 
 
 
214 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  26.95 
 
 
210 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  28.7 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  36.49 
 
 
212 aa  43.9  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  30.33 
 
 
227 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  30.33 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  30.33 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  30.33 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  30.33 
 
 
227 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  28.69 
 
 
214 aa  42.7  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  30.33 
 
 
228 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  24.12 
 
 
227 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  30 
 
 
248 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  29.17 
 
 
214 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>