32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6727 on replicon NC_013731
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013731  Slin_6727  glutamine cyclotransferase  100 
 
 		 362 aa  745    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.740303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2500  glutamine cyclotransferase  46.02 
 
 		 253 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0828  glutamine cyclotransferase  44.39 
 
 		 272 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2462  glutamine cyclotransferase  46.67 
 
 		 262 aa  183  4.0000000000000006e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704025  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00869  glutamine cyclotransferase  40.89 
 
 		 272 aa  177  2e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.268482  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4569  glutamine cyclotransferase  33.52 
 
 		 349 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20936  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0278  glutamine cyclotransferase  34.07 
 
 		 364 aa  176  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.286822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1498  glutamine cyclotransferase  42.6 
 
 		 256 aa  176  5e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0484  glutamine cyclotransferase  40.53 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  39.04 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10783  Glutamine cyclotransferase  35.16 
 
 		 348 aa  173  5e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34010  glutamine cyclotransferase  40 
 
 		 277 aa  166  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.334448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3145  glutamine cyclotransferase  40.53 
 
 		 276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0504  hypothetical protein  39.06 
 
 		 263 aa  166  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000894372  hitchhiker  0.00102967 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4041  glutamine cyclotransferase  39.06 
 
 		 263 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.66417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0172  glutamine cyclotransferase  39.06 
 
 		 263 aa  166  6.9999999999999995e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3371  glutamine cyclotransferase  40.36 
 
 		 279 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0451  glutamine cyclotransferase  39.65 
 
 		 255 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267078  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1065  glutamine cyclotransferase  40.09 
 
 		 257 aa  161  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2647  glutamine cyclotransferase  39.27 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2944  glutamine cyclotransferase  38.63 
 
 		 264 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2900  glutamine cyclotransferase  38.63 
 
 		 264 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1974  glutamine cyclotransferase  31.03 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.424232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  38.43 
 
 		 264 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1980  glutamine cyclotransferase  39.75 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1326  glutamine cyclotransferase  37.29 
 
 		 263 aa  152  8e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.211339  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5761  glutamine cyclotransferase  38.74 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1300  glutamine cyclotransferase  36.05 
 
 		 274 aa  146  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1469  glutamine cyclotransferase-like  35.68 
 
 		 284 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50239  predicted protein  36.32 
 
 		 377 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_6083  predicted protein  32.35 
 
 		 251 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734662  normal  0.474336 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44182  predicted protein  30.62 
 
 		 613 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>