32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0484 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0484  glutamine cyclotransferase  100 
 
 		 259 aa  506  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1065  glutamine cyclotransferase  59.69 
 
 		 257 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34010  glutamine cyclotransferase  57.31 
 
 		 277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.334448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5761  glutamine cyclotransferase  62.5 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3145  glutamine cyclotransferase  56.77 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2900  glutamine cyclotransferase  53.54 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2944  glutamine cyclotransferase  53.54 
 
 		 264 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  53.15 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2462  glutamine cyclotransferase  45.74 
 
 		 262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704025  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  44.87 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0828  glutamine cyclotransferase  40.17 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00869  glutamine cyclotransferase  45.74 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.268482  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2500  glutamine cyclotransferase  44.16 
 
 		 253 aa  189  4e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0172  glutamine cyclotransferase  41.99 
 
 		 263 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4041  glutamine cyclotransferase  41.99 
 
 		 263 aa  188  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.66417  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1498  glutamine cyclotransferase  46.15 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1300  glutamine cyclotransferase  45.98 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0504  hypothetical protein  41.56 
 
 		 263 aa  186  3e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000894372  hitchhiker  0.00102967 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0451  glutamine cyclotransferase  45.5 
 
 		 255 aa  185  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267078  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10783  Glutamine cyclotransferase  37.89 
 
 		 348 aa  184  9e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0278  glutamine cyclotransferase  36.64 
 
 		 364 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.286822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2647  glutamine cyclotransferase  42.75 
 
 		 330 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3371  glutamine cyclotransferase  45.25 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1980  glutamine cyclotransferase  45.9 
 
 		 289 aa  180  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1469  glutamine cyclotransferase-like  38.29 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6727  glutamine cyclotransferase  40.53 
 
 		 362 aa  176  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.740303 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1974  glutamine cyclotransferase  40.61 
 
 		 349 aa  174  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.424232  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4569  glutamine cyclotransferase  35.2 
 
 		 349 aa  174  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20936  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1326  glutamine cyclotransferase  42.61 
 
 		 263 aa  169  4e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.211339  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50239  predicted protein  41.13 
 
 		 377 aa  159  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44182  predicted protein  38.1 
 
 		 613 aa  138  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_6083  predicted protein  35.17 
 
 		 251 aa  96.7  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734662  normal  0.474336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>