32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4569 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4569  glutamine cyclotransferase  100 
 
 
349 aa  703    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.20936  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10783  Glutamine cyclotransferase  44.08 
 
 
348 aa  273  2.0000000000000002e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459994  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0278  glutamine cyclotransferase  41.18 
 
 
364 aa  241  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.286822  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2462  glutamine cyclotransferase  48.66 
 
 
262 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704025  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1974  glutamine cyclotransferase  39.24 
 
 
349 aa  231  2e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.424232  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2500  glutamine cyclotransferase  46.26 
 
 
253 aa  226  6e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2647  glutamine cyclotransferase  42.98 
 
 
330 aa  202  5e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0828  glutamine cyclotransferase  43.17 
 
 
272 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.168096  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  41.38 
 
 
256 aa  196  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3371  glutamine cyclotransferase  43.05 
 
 
279 aa  192  8e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00869  glutamine cyclotransferase  41.05 
 
 
272 aa  189  5.999999999999999e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.268482  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1326  glutamine cyclotransferase  39.64 
 
 
263 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.211339  normal  0.38005 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0451  glutamine cyclotransferase  41.15 
 
 
255 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0267078  normal  0.572898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1498  glutamine cyclotransferase  39.73 
 
 
256 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.111324 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4041  glutamine cyclotransferase  40.77 
 
 
263 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.66417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0172  glutamine cyclotransferase  40.77 
 
 
263 aa  181  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0504  hypothetical protein  40.34 
 
 
263 aa  179  5.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000894372  hitchhiker  0.00102967 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6727  glutamine cyclotransferase  33.52 
 
 
362 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.740303 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1300  glutamine cyclotransferase  39.82 
 
 
274 aa  173  3.9999999999999995e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0484  glutamine cyclotransferase  35 
 
 
259 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3145  glutamine cyclotransferase  35.24 
 
 
276 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.859253  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50239  predicted protein  39.13 
 
 
377 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1065  glutamine cyclotransferase  35.37 
 
 
257 aa  159  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1980  glutamine cyclotransferase  36.55 
 
 
289 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5761  glutamine cyclotransferase  34.56 
 
 
256 aa  157  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.651686  normal  0.0887235 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1469  glutamine cyclotransferase-like  36.52 
 
 
284 aa  153  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2944  glutamine cyclotransferase  33.48 
 
 
264 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2900  glutamine cyclotransferase  33.48 
 
 
264 aa  151  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34010  glutamine cyclotransferase  33.33 
 
 
277 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.334448  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  33.93 
 
 
264 aa  149  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44182  predicted protein  32.14 
 
 
613 aa  119  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_6083  predicted protein  32.35 
 
 
251 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734662  normal  0.474336 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>