45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0082 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  78.83 
 
 
227 aa  360  8e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  80.2 
 
 
245 aa  331  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  74.76 
 
 
210 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  73.33 
 
 
210 aa  314  6e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  70.95 
 
 
216 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  73.68 
 
 
227 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  73.68 
 
 
227 aa  308  5e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  73.68 
 
 
227 aa  307  9e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  73.68 
 
 
227 aa  307  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  73.68 
 
 
227 aa  307  9e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  73.68 
 
 
227 aa  307  9e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  71.77 
 
 
227 aa  307  9e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  71.77 
 
 
227 aa  306  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  72.82 
 
 
228 aa  305  3e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  71.57 
 
 
225 aa  305  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  69.34 
 
 
226 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  70.81 
 
 
228 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  70.81 
 
 
228 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  70.81 
 
 
228 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  70.48 
 
 
214 aa  303  1.0000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  70 
 
 
223 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  72.46 
 
 
220 aa  301  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  68.57 
 
 
214 aa  300  9e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  68.57 
 
 
214 aa  300  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  69.34 
 
 
213 aa  299  2e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  68.9 
 
 
214 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  69.76 
 
 
213 aa  296  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  65.09 
 
 
212 aa  289  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  67.92 
 
 
248 aa  284  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  67.45 
 
 
248 aa  282  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  67.96 
 
 
244 aa  278  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2359  hypothetical protein  67.14 
 
 
218 aa  277  8e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137558  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  63.64 
 
 
212 aa  277  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  69.86 
 
 
210 aa  277  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  72.55 
 
 
228 aa  275  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2670  hypothetical protein  69.38 
 
 
218 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  65.85 
 
 
213 aa  271  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  67.46 
 
 
210 aa  263  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2408  streptogramin lyase  77.61 
 
 
152 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0847  hypothetical protein  31.09 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1722  glutamine cyclotransferase  28.06 
 
 
256 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.767878  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  28.23 
 
 
359 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0604  hypothetical protein  30.48 
 
 
310 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  27.42 
 
 
386 aa  44.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>