33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0847 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0847  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  517  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00187018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  28.93 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  30.25 
 
 
220 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  31.4 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  28.1 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  27.27 
 
 
216 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  30.25 
 
 
222 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  26.45 
 
 
227 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  27.05 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  27.42 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  27.42 
 
 
227 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  27.87 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  26.67 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  28.99 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  27.05 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  26.67 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  26.67 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  26.67 
 
 
227 aa  47.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  27.05 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  27.05 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  27.27 
 
 
210 aa  47  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  25.32 
 
 
244 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  26.45 
 
 
210 aa  46.2  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  26.23 
 
 
226 aa  45.8  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  26.23 
 
 
213 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  25.83 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  26.45 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  25.83 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  25.83 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  26.23 
 
 
213 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  24.68 
 
 
248 aa  43.5  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  23.97 
 
 
212 aa  42  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  27.42 
 
 
210 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>