49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3203 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  80.48 
 
 
210 aa  362  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  80 
 
 
210 aa  361  6e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  79.91 
 
 
214 aa  359  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  78.97 
 
 
214 aa  355  1.9999999999999998e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  78.47 
 
 
214 aa  354  5.999999999999999e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  76.78 
 
 
226 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  75.93 
 
 
228 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  75.93 
 
 
228 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  75.93 
 
 
228 aa  353  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  77.57 
 
 
227 aa  351  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  77.57 
 
 
227 aa  350  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  76.53 
 
 
225 aa  350  1e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  77.57 
 
 
227 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  77.57 
 
 
227 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  77.57 
 
 
227 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  77.57 
 
 
227 aa  350  1e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  77.25 
 
 
227 aa  348  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  77.99 
 
 
227 aa  348  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  78.16 
 
 
228 aa  344  6e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  74.41 
 
 
213 aa  333  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  71.56 
 
 
223 aa  328  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  69.19 
 
 
212 aa  326  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  70.75 
 
 
212 aa  323  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  69.81 
 
 
214 aa  318  3.9999999999999996e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2670  hypothetical protein  76.56 
 
 
218 aa  313  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  70.95 
 
 
222 aa  313  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2359  hypothetical protein  75.23 
 
 
218 aa  312  1.9999999999999998e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137558  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  74.64 
 
 
210 aa  312  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  70.7 
 
 
213 aa  312  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  73.61 
 
 
228 aa  311  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  70.73 
 
 
227 aa  312  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  73.68 
 
 
210 aa  309  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  73.13 
 
 
245 aa  308  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  66.2 
 
 
213 aa  308  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  68.45 
 
 
220 aa  303  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  67.65 
 
 
244 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  66.99 
 
 
248 aa  278  5e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  64.93 
 
 
248 aa  276  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2408  streptogramin lyase  80.77 
 
 
152 aa  218  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0847  hypothetical protein  27.27 
 
 
256 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00187018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  26.83 
 
 
386 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2195  hypothetical protein  26.34 
 
 
212 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202937  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  26.61 
 
 
359 aa  44.3  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2846  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.24 
 
 
333 aa  43.5  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5007  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.58 
 
 
410 aa  42.7  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  25.3 
 
 
264 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0588  transglutaminase domain protein  23.72 
 
 
574 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.618146  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  24.35 
 
 
479 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>