18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2195 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2195  hypothetical protein  100 
 
 
212 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202937  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2182  hypothetical protein  32.32 
 
 
223 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0541335 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  27.6 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  28.06 
 
 
214 aa  48.1  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  26.94 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  31.34 
 
 
245 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  26.34 
 
 
216 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  27.23 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  26.42 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  27.04 
 
 
227 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  30.84 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  30.84 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  31.25 
 
 
210 aa  43.1  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  24.27 
 
 
213 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  26.32 
 
 
228 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  26.32 
 
 
228 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  32.56 
 
 
223 aa  41.6  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  28.28 
 
 
212 aa  41.6  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>