46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6318 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  78.83 
 
 		 222 aa  360  9e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  81.22 
 
 		 245 aa  330  1e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  70.73 
 
 		 216 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  71.71 
 
 		 210 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  69.05 
 
 		 214 aa  307  9e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  69.05 
 
 		 214 aa  306  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  70.73 
 
 		 210 aa  305  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  71.01 
 
 		 220 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  71.22 
 
 		 227 aa  304  9.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  71.22 
 
 		 227 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  72.95 
 
 		 248 aa  301  5.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  69.12 
 
 		 225 aa  300  8.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  72.46 
 
 		 248 aa  300  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  68.42 
 
 		 228 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  67.79 
 
 		 226 aa  300  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  68.42 
 
 		 228 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  68.42 
 
 		 228 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  71.78 
 
 		 228 aa  299  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  71.71 
 
 		 227 aa  298  6e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  71.71 
 
 		 227 aa  297  7e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  71.71 
 
 		 227 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  71.71 
 
 		 227 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  71.71 
 
 		 227 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  71.71 
 
 		 227 aa  297  1e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  72.46 
 
 		 244 aa  297  1e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  68.63 
 
 		 214 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  66.5 
 
 		 214 aa  291  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  69.76 
 
 		 223 aa  291  7e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  67.8 
 
 		 213 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  65.87 
 
 		 212 aa  289  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  66.18 
 
 		 213 aa  288  6e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  62.44 
 
 		 212 aa  275  5e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2359  hypothetical protein  65.75 
 
 		 218 aa  274  9e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  68.9 
 
 		 228 aa  272  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2670  hypothetical protein  66.35 
 
 		 218 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  66.67 
 
 		 210 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  62.93 
 
 		 213 aa  263  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  63.77 
 
 		 210 aa  256  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2408  streptogramin lyase  74.63 
 
 		 152 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0847  hypothetical protein  26.45 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00187018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  24.86 
 
 		 359 aa  46.6  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2195  hypothetical protein  27.04 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  26.24 
 
 		 386 aa  45.4  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  29.52 
 
 		 3041 aa  43.9  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4964  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  31.33 
 
 		 529 aa  42  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>