47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2028 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_2028  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0543675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1897  hypothetical protein  99.12 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1995  hypothetical protein  87.72 
 
 		 228 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.151906  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2015  hypothetical protein  88.16 
 
 		 228 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6082  hypothetical protein  87.72 
 
 		 228 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5305  hypothetical protein  87.39 
 
 		 226 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.807695  normal  0.128742 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1281  hypothetical protein  87.16 
 
 		 225 aa  391  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0668131  normal  0.409619 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4114  hypothetical protein  81.82 
 
 		 210 aa  360  1e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0542  hypothetical protein  80.38 
 
 		 210 aa  360  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.468066  normal  0.624086 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2461  hypothetical protein  79.07 
 
 		 227 aa  353  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.505194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2555  hypothetical protein  79.07 
 
 		 227 aa  353  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2028  hypothetical protein  79.07 
 
 		 227 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3284  hypothetical protein  79.07 
 
 		 227 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1299  hypothetical protein  79.07 
 
 		 227 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0355  hypothetical protein  78.5 
 
 		 214 aa  352  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.902598 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1528  hypothetical protein  79.07 
 
 		 227 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.176269  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3203  hypothetical protein  76.17 
 
 		 216 aa  350  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2053  hypothetical protein  79.61 
 
 		 228 aa  345  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345604  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1375  hypothetical protein  75.23 
 
 		 214 aa  342  2.9999999999999997e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1311  hypothetical protein  75.23 
 
 		 214 aa  341  5e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0140085  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5693  hypothetical protein  73.46 
 
 		 212 aa  327  8e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6466  hypothetical protein  72.9 
 
 		 223 aa  325  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.5697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0991  hypothetical protein  74.06 
 
 		 213 aa  324  5e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.951692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1330  hypothetical protein  69.81 
 
 		 212 aa  319  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.694288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4058  hypothetical protein  72.12 
 
 		 214 aa  313  9.999999999999999e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2340  hypothetical protein  74.16 
 
 		 210 aa  310  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.444709  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0082  hypothetical protein  71.77 
 
 		 222 aa  308  5.9999999999999995e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0025  hypothetical protein  72.73 
 
 		 228 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.276597 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6318  hypothetical protein  70 
 
 		 227 aa  304  7e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2670  hypothetical protein  72.04 
 
 		 218 aa  304  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6461  hypothetical protein  66.2 
 
 		 213 aa  301  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.948806  normal  0.710124 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3201  hypothetical protein  70.39 
 
 		 220 aa  300  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4850  hypothetical protein  71.9 
 
 		 210 aa  296  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.992722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3152  hypothetical protein  68.22 
 
 		 213 aa  294  9e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3608  hypothetical protein  69.15 
 
 		 245 aa  290  9e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2359  hypothetical protein  67.44 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.137558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0344  hypothetical protein  65.2 
 
 		 244 aa  266  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.359735  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0360  hypothetical protein  65.37 
 
 		 248 aa  265  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0235527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0373  hypothetical protein  62.67 
 
 		 248 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0698829  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2408  streptogramin lyase  76.43 
 
 		 152 aa  221  7e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3908  periplasmic ligand-binding sensor protein  28 
 
 		 386 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0847  hypothetical protein  27.42 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00187018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2154  two component regulator propeller domain-containing protein  27.42 
 
 		 359 aa  47  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2195  hypothetical protein  30.84 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0202937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2182  hypothetical protein  28.57 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0541335 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0329  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.57 
 
 		 553 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2930  glutamine cyclotransferase  25.43 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.238347  normal  0.0784763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>