40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4080 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_1647  hypothetical protein  99.91 
 
 
1124 aa  2291    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4080  hypothetical protein  100 
 
 
1124 aa  2296    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.292091  normal  0.032057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0792  gene transfer agent (GTA) like protein  28.02 
 
 
1313 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.780926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1426  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  28.2 
 
 
1284 aa  121  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1181  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  27 
 
 
1285 aa  118  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2599  gene transfer agent (GTA) like protein  28.29 
 
 
1301 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4296  gene transfer agent (GTA) like protein  28.01 
 
 
1301 aa  108  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7312  gene transfer agent (GTA) like protein  29.01 
 
 
1300 aa  106  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6574  gene transfer agent (GTA) like protein  29.01 
 
 
1300 aa  105  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2012  gene transfer agent (GTA) like protein  29.01 
 
 
1300 aa  105  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190757  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1993  gene transfer agent (GTA) orfg15  26.95 
 
 
1283 aa  105  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.263252  normal  0.679187 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1824  gene transfer agent (GTA) orfg15  28.38 
 
 
1280 aa  104  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51325  normal  0.391339 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0270  gene transfer agent (GTA) like protein  27.75 
 
 
1339 aa  103  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.67619  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5975  gene transfer agent (GTA) like protein  29.06 
 
 
1301 aa  101  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.161454 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2489  hypothetical protein  25.15 
 
 
1076 aa  99.8  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2887  putative phage host specificity protein  29.59 
 
 
1296 aa  98.6  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0568102  normal  0.211291 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3171  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  27.47 
 
 
1300 aa  95.9  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.997359  normal  0.0327353 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7158  hypothetical protein  25 
 
 
1056 aa  89.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0559079  normal  0.193255 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3458  gene transfer agent (GTA) orfg15  27.79 
 
 
1297 aa  87  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.384127  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0836  hypothetical protein  19.39 
 
 
1201 aa  86.7  0.000000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3901  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  29.46 
 
 
1279 aa  83.2  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.75252  normal  0.0322249 
 
 
-
 
NC_002978  WD0382  hypothetical protein  21.09 
 
 
1111 aa  80.1  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0919  gene transfer agent (GTA) like protein  27.69 
 
 
1286 aa  77.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3077  gene transfer agent (GTA) like protein  26.76 
 
 
996 aa  77.4  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.759421  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2122  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  28.05 
 
 
1290 aa  77  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0264351  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0253  hypothetical protein  19.96 
 
 
1206 aa  73.2  0.00000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1418  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  24.89 
 
 
1302 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170545  normal  0.0550012 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1646  hypothetical protein  27.17 
 
 
1483 aa  68.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.734787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1414  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  26.57 
 
 
1300 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.186863  normal  0.0805686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1089  hypothetical protein  25.92 
 
 
1297 aa  66.6  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.466235  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1144  putative phage host specificity protein  46.15 
 
 
1296 aa  64.3  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383644  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2479  putative phage host specificity protein  46.15 
 
 
1296 aa  63.9  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1072  hypothetical protein  49.12 
 
 
1306 aa  63.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0995947 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4980  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  25.71 
 
 
1302 aa  61.2  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2163  hypothetical protein  37.61 
 
 
1305 aa  61.6  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3714  hypothetical protein  26.26 
 
 
1117 aa  59.3  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0600  hypothetical protein  23.06 
 
 
1287 aa  58.5  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1692  gene transfer agent (GTA) orfg15, like protein  25.48 
 
 
1302 aa  57  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.281256  normal  0.701211 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3058  conserved hypothetical protein, putative phage associated protein  28.24 
 
 
711 aa  53.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0933  gene transfer agent (GTA) orfg15  27.13 
 
 
1252 aa  52.8  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.264711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>