More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10998 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  100 
 
 
457 aa  835    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12634  PE-PGRS family protein  99.2 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000268791  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10996  PE-PGRS family protein  87.3 
 
 
313 aa  171  3e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7191000000000003e-35  normal  0.547752 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  56.86 
 
 
1094 aa  136  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12868  PE-PGRS family protein  58.87 
 
 
663 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00218222  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11480  PE-PGRS family protein  60.8 
 
 
737 aa  124  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.94455e-50  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1435  hypothetical protein  51.79 
 
 
335 aa  123  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.61404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0101  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  56.21 
 
 
354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11478  PE-PGRS family protein  63.95 
 
 
1407 aa  117  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000217058  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1242  hypothetical protein  53.59 
 
 
810 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  48.72 
 
 
1667 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10889  PE-PGRS family protein  54.84 
 
 
609 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.275087  normal  0.540095 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1704  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  53.74 
 
 
689 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0108  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  56.86 
 
 
354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11796  PE-PGRS family protein  58.73 
 
 
618 aa  111  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000152846 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5104  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  50.98 
 
 
366 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.109087 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13545  PE-PGRS family protein  58.06 
 
 
1888 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000435663  hitchhiker  0.000141751 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0109  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  54.9 
 
 
354 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  49.67 
 
 
752 aa  109  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13378  PE-PGRS family protein  66.47 
 
 
1570 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.793451  normal  0.887646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0107  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  56.13 
 
 
272 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10995  PE-PGRS family protein  50.39 
 
 
923 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.02084e-24  normal  0.770391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12611  PE-PGRS family protein  51.33 
 
 
543 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0987331  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10588  PE-PGRS family protein  57.72 
 
 
1306 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00297042  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12513  PE-PGRS family protein  53.85 
 
 
272 aa  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.7912e-70  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  50 
 
 
819 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11834  PE-PGRS family protein  55.65 
 
 
650 aa  106  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00239965  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6378  hypothetical protein  48.39 
 
 
556 aa  106  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.355816 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12014  PE-PGRS family protein  51.56 
 
 
558 aa  106  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13542  PE-PGRS family protein  62.1 
 
 
2332 aa  106  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000034434  hitchhiker  0.00332748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13547  PE-PGRS family protein  62.6 
 
 
1086 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.98986e-36  hitchhiker  0.0000786536 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2353  triple helix repeat-containing collagen  47.74 
 
 
580 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5389  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  53.85 
 
 
365 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.187033  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13422  PE-PGRS family protein  54.84 
 
 
731 aa  104  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000255336  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12754  PE-PGRS family protein  57.26 
 
 
565 aa  103  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000417196  normal  0.0386161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11086  PE-PGRS family protein  54.03 
 
 
463 aa  102  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.21582e-33  normal  0.255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11469  PE-PGRS family protein  57.25 
 
 
491 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0503304  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0104  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  51.32 
 
 
353 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13628  PE-PGRS family protein  57.26 
 
 
439 aa  101  3e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000236295  normal  0.0644121 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1111  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  46.41 
 
 
415 aa  100  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2380  hypothetical protein  37.58 
 
 
250 aa  100  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2393  hypothetical protein  51.02 
 
 
391 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0136177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10847  PE-PGRS family protein  56.91 
 
 
137 aa  100  7e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.4239e-69  hitchhiker  0.000000132499 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4419  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  48.3 
 
 
1170 aa  99.8  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.834695  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10849  PE-PGRS family protein  59.38 
 
 
879 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4370299999999996e-27  hitchhiker  0.00000147431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12653  PE-PGRS family protein  57.94 
 
 
788 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000028408  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11357  PE-PGRS family protein  53.66 
 
 
603 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0271727  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10110  PE-PGRS family protein  52.55 
 
 
533 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2584  surface antigen gene  43.79 
 
 
479 aa  96.3  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.223545  normal  0.185762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11848  PE-PGRS family protein  60.48 
 
 
518 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114393  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12540  PE family protein  45.03 
 
 
492 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000611241  hitchhiker  0.0026092 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0162  hypothetical protein  50.76 
 
 
387 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13114  hypothetical protein  56 
 
 
437 aa  94  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.773081 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3263  hypothetical protein  46.34 
 
 
487 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000325549  normal  0.271166 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  45.28 
 
 
971 aa  94  6e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12424  PE-PGRS family protein  53.54 
 
 
382 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.712465  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.66 
 
 
314 aa  93.6  8e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0103  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  56.56 
 
 
192 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2474  serine/threonine protein kinase  45.21 
 
 
776 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000122678  hitchhiker  0.00951365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13623  PE-PGRS family protein  58.27 
 
 
584 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91824e-18  normal  0.0516609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11105  PE-PGRS family protein  51.97 
 
 
779 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.19894e-57  normal  0.745031 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11496  PE-PGRS family protein  56.45 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000634061  normal  0.0755488 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.06 
 
 
318 aa  89  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11669  PE-PGRS family protein  49.6 
 
 
549 aa  89  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.43838e-17  normal  0.300456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  37.01 
 
 
314 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13403  PE-PGRS family protein  48.99 
 
 
591 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000216419  normal  0.654566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10284  PE-PGRS family protein  56.52 
 
 
372 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.00543e-83  normal  0.307797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11783  PE-PGRS family protein  59.42 
 
 
911 aa  87  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.68379e-22  hitchhiker  0.0000000263323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1813  hypothetical protein  44.3 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  42.48 
 
 
943 aa  85.5  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10125  PE-PGRS family protein  58.54 
 
 
561 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000011228  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11085  PE-PGRS family protein  54.03 
 
 
667 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.21525e-28  normal  0.25323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3620  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.96 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.793181  normal  0.0342651 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2124  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.27 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0490929  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1651  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  43.75 
 
 
366 aa  84  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0495995  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12192  PE-PGRS family protein  40.27 
 
 
532 aa  83.6  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9578499999999997e-20  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0102  40-residue YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  50.36 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11269  PE-PGRS family protein  56.67 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119088  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3045  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.46 
 
 
313 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.425912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0874  cell surface protein  42.86 
 
 
332 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.560524  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13541  PE-PGRS family protein  53.7 
 
 
1403 aa  80.1  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.3382500000000002e-18  hitchhiker  0.000118269 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4384  hypothetical protein  40.52 
 
 
314 aa  80.1  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.491749  normal  0.153461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2259  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.97 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.669403  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12351  PE family protein  46.55 
 
 
382 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4199  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.13 
 
 
316 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13098  normal  0.347847 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0027  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  37.4 
 
 
328 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.804553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10304  PE-PGRS family protein  57.26 
 
 
622 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0360601  normal  0.165119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2669  YVTN family beta-propeller repeat-containing protein  34.43 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10285  PE-PGRS family protein  62.77 
 
 
906 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.9295399999999998e-51  normal  0.572415 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  29.39 
 
 
517 aa  77.8  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3094  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.43 
 
 
329 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12509  PE-PGRS family protein  55.65 
 
 
431 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.90533e-20  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3583  hypothetical protein  47.22 
 
 
1189 aa  77  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.970923  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3937  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.92 
 
 
334 aa  77  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328417  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  48 
 
 
502 aa  76.6  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3134  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34.43 
 
 
329 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11868  PE-PGRS family protein  53.66 
 
 
515 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000473061  normal  0.517398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11112  PE-PGRS family protein  55.91 
 
 
853 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336586  normal  0.286221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11663  PE family protein  43.17 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2665  hypothetical protein  33.33 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320211  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>