20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3939 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3939  NHL repeat-containing protein  100 
 
 
454 aa  875    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0801194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1014  NHL repeat containing protein  32.86 
 
 
444 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00195026  normal  0.319723 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  30.49 
 
 
950 aa  135  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0416  hypothetical protein  28.93 
 
 
673 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0810829 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  21.95 
 
 
1030 aa  53.9  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  30.89 
 
 
621 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  23.83 
 
 
1026 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2141  hypothetical protein  28.11 
 
 
346 aa  46.6  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  20.83 
 
 
927 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  35 
 
 
1140 aa  45.8  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  22.98 
 
 
646 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8646  NHL repeat containing protein  23.95 
 
 
658 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  22.22 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.27 
 
 
1146 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  22.22 
 
 
831 aa  45.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.55 
 
 
930 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1929  two component regulator propeller domain protein  29.63 
 
 
775 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00113538  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.99 
 
 
1079 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0903  NHL repeat-containing protein  23.42 
 
 
664 aa  43.9  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.772896  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  26.24 
 
 
1418 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>