40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8646 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8646  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 658 aa  1310    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0841  NHL repeat containing protein  39.18 
 
 		 621 aa  348  2e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1496  NHL repeat-containing protein  28.26 
 
 		 673 aa  196  1e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0903  NHL repeat-containing protein  29.31 
 
 		 664 aa  195  2e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.772896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21261  NHL repeat-containing protein  26.09 
 
 		 570 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.404692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5167  hypothetical protein  24.06 
 
 		 708 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665206  hitchhiker  0.000692759 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0316  hypothetical protein  32.89 
 
 		 439 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  30 
 
 		 709 aa  63.5  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  26.49 
 
 		 664 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  25.53 
 
 		 668 aa  62  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  24.63 
 
 		 930 aa  62  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  24.57 
 
 		 831 aa  60.8  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  27.83 
 
 		 1146 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  24.13 
 
 		 346 aa  57.8  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  23.22 
 
 		 522 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1165  NHL repeat containing protein  24.51 
 
 		 950 aa  56.6  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0259008 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13557  hypothetical protein  25.71 
 
 		 343 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000762607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  26.42 
 
 		 1163 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  25 
 
 		 391 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  23.88 
 
 		 307 aa  50.8  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  27.98 
 
 		 418 aa  50.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  23.91 
 
 		 579 aa  50.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  23.39 
 
 		 786 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.89 
 
 		 1272 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  23.08 
 
 		 1030 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  23.9 
 
 		 363 aa  48.9  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  31.25 
 
 		 373 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  24.4 
 
 		 1230 aa  47.4  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  25.81 
 
 		 365 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  21.83 
 
 		 392 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  23.46 
 
 		 930 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  29.55 
 
 		 1557 aa  46.2  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  24.68 
 
 		 627 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  23.72 
 
 		 850 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  24.02 
 
 		 387 aa  45.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  28.03 
 
 		 743 aa  44.7  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  29.25 
 
 		 355 aa  44.3  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  24.31 
 
 		 355 aa  44.3  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3112  NHL repeat containing protein  23.37 
 
 		 436 aa  43.9  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  24.87 
 
 		 379 aa  43.9  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>