16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1580 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_1580  large, multifunctional secreted protein  100 
 
 
506 aa  1052    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1439  hypothetical protein  46.04 
 
 
509 aa  459  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421301  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  43.19 
 
 
722 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  39.96 
 
 
673 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  41.87 
 
 
669 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  40.86 
 
 
647 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  37.31 
 
 
669 aa  340  2.9999999999999998e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  38.54 
 
 
663 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  37.45 
 
 
491 aa  336  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  36.17 
 
 
656 aa  330  3e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  34.82 
 
 
502 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5004  hypothetical protein  26.64 
 
 
1010 aa  139  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  24.38 
 
 
920 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  26.06 
 
 
363 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3737  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  26.37 
 
 
466 aa  53.5  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1436  heme-binding protein  27.48 
 
 
1058 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>