18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5004 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5004  hypothetical protein  100 
 
 		 1010 aa  2098    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5289  cytochrome c class I  29.14 
 
 		 920 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1171  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.88 
 
 		 491 aa  166  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1580  large, multifunctional secreted protein  26.64 
 
 		 506 aa  139  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.10938  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  27.29 
 
 		 502 aa  135  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1880  blue (type 1) copper domain protein  26.57 
 
 		 722 aa  119  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.459048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  24.62 
 
 		 647 aa  112  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  24.29 
 
 		 663 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000987167  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  24.31 
 
 		 669 aa  105  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  24.16 
 
 		 656 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6137  blue (type 1) copper domain protein  27.1 
 
 		 669 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1439  hypothetical protein  23.87 
 
 		 509 aa  100  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421301  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  26.4 
 
 		 673 aa  99.4  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4620  heme-binding protein  24.89 
 
 		 1143 aa  49.3  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0029  membrane-bound dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 1201 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.167421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0421  glucose sorbosone dehydrogenase  28.48 
 
 		 363 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000245782  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3330  cytochrome c, class I  30.49 
 
 		 296 aa  44.7  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.606623  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2704  Quinoprotein glucose dehydrogenase  30.77 
 
 		 731 aa  44.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>