36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0308 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0308  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  551  1e-156  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.633758  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2944  hypothetical protein  91.57 
 
 		 261 aa  498  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175971  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3808  hypothetical protein  82.02 
 
 		 297 aa  457  9.999999999999999e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5495  protein of unknown function DUF1037  81.99 
 
 		 261 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0242413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3007  protein of unknown function DUF1037  81.61 
 
 		 261 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5571  trehalose utilization-related protein  78.93 
 
 		 261 aa  437  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3258  protein of unknown function DUF1037  80.84 
 
 		 261 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.955275  normal  0.458439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0143  hypothetical protein  75.48 
 
 		 261 aa  414  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4438  hypothetical protein  72.03 
 
 		 261 aa  391  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.319512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0027  hypothetical protein  60.92 
 
 		 259 aa  340  1e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2986  hypothetical protein  64.32 
 
 		 247 aa  314  8e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.102363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3205  hypothetical protein  58.62 
 
 		 267 aa  304  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2950  protein of unknown function DUF1037  63.52 
 
 		 249 aa  299  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1236  protein of unknown function DUF1037  57.92 
 
 		 239 aa  278  5e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0127  hypothetical protein  61.11 
 
 		 253 aa  278  6e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2202  protein of unknown function DUF1037  57.46 
 
 		 240 aa  275  7e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.468062  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2327  protein of unknown function DUF1037  56.49 
 
 		 237 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.74481  normal  0.762385 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2966  protein of unknown function DUF1037  60.09 
 
 		 248 aa  271  6e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4342  hypothetical protein  60.43 
 
 		 269 aa  271  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  decreased coverage  0.000860336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3468  hypothetical protein  54.87 
 
 		 257 aa  267  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3349  protein of unknown function DUF1037  58.56 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0165684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1570  protein of unknown function DUF1037  58.82 
 
 		 240 aa  263  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0388  protein of unknown function DUF1037  56.77 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.22301  decreased coverage  0.00488955 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1145  protein of unknown function DUF1037  56.11 
 
 		 265 aa  258  6e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3683  hypothetical protein  55.56 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1353  protein of unknown function DUF1037  63.3 
 
 		 247 aa  257  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17810  trehalose utilization protein  55.2 
 
 		 266 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.577067  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4439  protein of unknown function DUF1037  56.36 
 
 		 240 aa  252  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0057675  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27080  trehalose utilization protein  56 
 
 		 261 aa  248  7e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3775  protein of unknown function DUF1037  52.7 
 
 		 249 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1858  protein of unknown function DUF1037  52.94 
 
 		 242 aa  240  2e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1631  hypothetical protein  39.53 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4304  protein of unknown function DUF1037  25.1 
 
 		 285 aa  42.4  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6311  hypothetical protein  34 
 
 		 220 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.566642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6969  hypothetical protein  34 
 
 		 220 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.83544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1518  hypothetical protein  34 
 
 		 220 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>