195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2104 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2104  hypothetical protein  100 
 
 		 894 aa  1831    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.788762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2243  protein of unknown function DUF1080  36.15 
 
 		 884 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2463  hypothetical protein  36.19 
 
 		 257 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  32.77 
 
 		 1194 aa  102  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  34.58 
 
 		 1444 aa  94  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  34.48 
 
 		 1505 aa  90.5  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  58.33 
 
 		 562 aa  75.1  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  51.56 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  30.86 
 
 		 579 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  32.16 
 
 		 528 aa  73.9  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.03 
 
 		 518 aa  73.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.91 
 
 		 547 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  52.24 
 
 		 547 aa  72  0.00000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.03 
 
 		 550 aa  70.5  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  50.75 
 
 		 567 aa  70.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 581 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  29.89 
 
 		 579 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.75 
 
 		 533 aa  69.3  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.32 
 
 		 524 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  49.18 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  49.18 
 
 		 545 aa  67.8  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  47.54 
 
 		 568 aa  67.8  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  27.98 
 
 		 231 aa  67.4  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.67 
 
 		 923 aa  67  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.24 
 
 		 526 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.28 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.15 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.03 
 
 		 518 aa  64.3  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  47.54 
 
 		 528 aa  63.5  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  46.15 
 
 		 509 aa  64.3  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.48 
 
 		 544 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.67 
 
 		 554 aa  63.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.18 
 
 		 524 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  26.06 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.03 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  42.68 
 
 		 546 aa  62.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  48.44 
 
 		 534 aa  62  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  24.68 
 
 		 581 aa  62  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.77 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.77 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  46.05 
 
 		 549 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  42.31 
 
 		 570 aa  60.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  38.67 
 
 		 554 aa  60.1  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  49.15 
 
 		 502 aa  60.1  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  43.08 
 
 		 510 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  43.08 
 
 		 502 aa  60.1  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.08 
 
 		 547 aa  59.7  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45 
 
 		 506 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  43.55 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.88 
 
 		 545 aa  58.9  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  43.55 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  26.64 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.13 
 
 		 534 aa  58.5  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  43.55 
 
 		 563 aa  58.9  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  24.01 
 
 		 488 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.55 
 
 		 573 aa  58.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.55 
 
 		 548 aa  58.2  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.11 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.16 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.11 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.11 
 
 		 534 aa  58.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24 
 
 		 553 aa  57.4  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.21 
 
 		 545 aa  57.4  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  36.49 
 
 		 530 aa  57.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.67 
 
 		 518 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  43.33 
 
 		 562 aa  57.4  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.9 
 
 		 516 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  40 
 
 		 571 aa  56.6  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.03 
 
 		 525 aa  57  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.94 
 
 		 547 aa  56.6  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4186  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.66 
 
 		 614 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1851  putative dehydrogenase  40.32 
 
 		 116 aa  56.2  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.44 
 
 		 533 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.44 
 
 		 533 aa  55.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.44 
 
 		 533 aa  55.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  40.3 
 
 		 578 aa  55.5  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  45.61 
 
 		 547 aa  55.5  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  24.43 
 
 		 488 aa  55.1  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  42.62 
 
 		 647 aa  55.1  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  42.19 
 
 		 489 aa  55.1  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  40 
 
 		 582 aa  55.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.94 
 
 		 548 aa  54.7  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.43 
 
 		 533 aa  54.7  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.94 
 
 		 573 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.26 
 
 		 532 aa  54.7  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  43.55 
 
 		 539 aa  54.3  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.19 
 
 		 572 aa  53.9  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3248  hypothetical protein  45.31 
 
 		 480 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713925  normal  0.212703 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.81 
 
 		 566 aa  54.3  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  37.5 
 
 		 538 aa  54.3  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3718  hypothetical protein  45.31 
 
 		 483 aa  53.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3452  hypothetical protein  45.31 
 
 		 480 aa  53.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0700524  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  38.57 
 
 		 563 aa  53.5  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0134  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase  36.92 
 
 		 480 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  37.14 
 
 		 558 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  40 
 
 		 537 aa  52.4  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  23.78 
 
 		 488 aa  52.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  32.35 
 
 		 521 aa  52  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  40 
 
 		 537 aa  52.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.39 
 
 		 494 aa  52  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>