52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3919 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3919  chitinase II  100 
 
 		 695 aa  1436    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00105192  normal  0.0100672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21810  chitinase  22.6 
 
 		 374 aa  77  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0014  glycoside hydrolase family 18  24.6 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  24.9 
 
 		 428 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21670  Inactive glysosyl hydrolase family 18  24.52 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.057245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  24.24 
 
 		 470 aa  62  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3627  glycosy hydrolase family protein  23.51 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.266855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0646  glycoside hydrolase family protein  23.36 
 
 		 349 aa  61.2  0.00000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0248633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3294  glycoside hydrolase family protein  23.11 
 
 		 430 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000717596  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3314  glycosyl hydrolase  23.11 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000190011  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3364  glycosyl hydrolase  23.11 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000727099  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3618  glycosyl hydrolase, family 18  23.11 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000703851 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1600  glycosyl hydrolase, family 18  23.11 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000035031  hitchhiker  0.0000741808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3715  glycosyl hydrolase, family 18  23.11 
 
 		 430 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  23.05 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  22.65 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0072  glycoside hydrolase family 18  24.22 
 
 		 384 aa  58.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000514122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3668  glycosy hydrolase family protein  22.71 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0200729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3402  glycosy hydrolase family protein  22.71 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0158491  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  23.55 
 
 		 1118 aa  55.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2256  glycoside hydrolase family protein  22.83 
 
 		 430 aa  55.1  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00349057  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1378  glycoside hydrolase family 18  25.32 
 
 		 647 aa  54.7  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0307  glycoside hydrolase family protein  25.5 
 
 		 426 aa  54.7  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8234  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0992  glycoside hydrolase family 18  22.18 
 
 		 426 aa  54.3  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00884991  hitchhiker  0.00000357477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0236  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 		 427 aa  52.4  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2245  glycoside hydrolase family 18  26.86 
 
 		 430 aa  51.6  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0196  glycoside hydrolase family 18  23.53 
 
 		 358 aa  51.6  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  22.37 
 
 		 431 aa  50.1  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01642  glycosyl hydrolase, family 18  22.63 
 
 		 343 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.107746  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0063  glycoside hydrolase family protein  26.02 
 
 		 312 aa  49.7  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2895  glycoside hydrolase family protein  19.23 
 
 		 583 aa  47.4  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.22791  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  28.68 
 
 		 868 aa  47.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  22.73 
 
 		 542 aa  47.4  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1815  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22.8 
 
 		 1115 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.259825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2159  glycoside hydrolase family protein  22.01 
 
 		 307 aa  46.2  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0242  glycoside hydrolase family 18  22.18 
 
 		 484 aa  46.2  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000747076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1652  peptidoglycan-binding LysM  20.59 
 
 		 423 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0437623  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  27.21 
 
 		 868 aa  46.6  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3443  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  23.2 
 
 		 1115 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  23.38 
 
 		 927 aa  45.8  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  27.94 
 
 		 868 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  27.21 
 
 		 868 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3749  glycoside hydrolase family protein  20.65 
 
 		 567 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.634589  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4489  glycoside hydrolase family 18  22.99 
 
 		 688 aa  45.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00179307  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  21.66 
 
 		 426 aa  45.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0424  glycoside hydrolase family protein  26.13 
 
 		 793 aa  44.7  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.723978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  27.21 
 
 		 867 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 		 868 aa  44.7  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1760  glycoside hydrolase family 18  22.49 
 
 		 444 aa  44.3  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3431  polysaccharide deacetylase/glycosyl transferase, group 2 family protein  22 
 
 		 1115 aa  44.3  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3135  group-specific protein  23.6 
 
 		 1119 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1167  glycoside hydrolase family protein  20.92 
 
 		 418 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000303009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>