133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2286 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  40.62 
 
 
591 aa  117  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  42.57 
 
 
323 aa  118  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  36.88 
 
 
269 aa  103  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  34.57 
 
 
269 aa  101  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  34.57 
 
 
269 aa  101  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.05 
 
 
431 aa  101  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  37.5 
 
 
262 aa  99  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  34.46 
 
 
262 aa  98.6  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  36.49 
 
 
266 aa  97.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  34.57 
 
 
269 aa  97.4  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  41.67 
 
 
535 aa  97.1  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  35.14 
 
 
267 aa  96.3  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  36.24 
 
 
481 aa  94.7  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.85 
 
 
657 aa  93.6  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  38.85 
 
 
340 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  35.37 
 
 
259 aa  88.2  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.25 
 
 
657 aa  87  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  34.93 
 
 
281 aa  86.3  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  34.06 
 
 
291 aa  85.9  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  45.63 
 
 
113 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  39.81 
 
 
529 aa  81.6  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  30.82 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  37.9 
 
 
553 aa  79  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  39.64 
 
 
282 aa  77.4  0.00000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  35.59 
 
 
292 aa  77.8  0.00000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  35.37 
 
 
276 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  39.29 
 
 
383 aa  75.9  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  41.03 
 
 
452 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  35.71 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  33.56 
 
 
298 aa  75.1  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  34.18 
 
 
483 aa  74.3  0.0000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0436  copper amine oxidase domain-containing protein  32.14 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  30.15 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  34.9 
 
 
446 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  34.78 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  36.19 
 
 
263 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  31.69 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  38.79 
 
 
541 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  30.77 
 
 
423 aa  69.3  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2097  copper amine oxidase domain protein  29.79 
 
 
258 aa  68.9  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.440325  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  31.61 
 
 
418 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.04 
 
 
907 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  35 
 
 
480 aa  68.6  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  31.19 
 
 
514 aa  68.2  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  33.81 
 
 
414 aa  68.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  36.36 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  36.75 
 
 
426 aa  67.8  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  30.83 
 
 
1305 aa  67.8  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  32.65 
 
 
403 aa  67  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  28.06 
 
 
320 aa  66.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  34.51 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  39.47 
 
 
948 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  35.94 
 
 
845 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  35.04 
 
 
451 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  39.18 
 
 
304 aa  65.1  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  30.51 
 
 
447 aa  65.1  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  41 
 
 
249 aa  63.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  36.61 
 
 
216 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  37.82 
 
 
495 aa  63.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  30.83 
 
 
352 aa  62.8  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  33.07 
 
 
478 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  32.76 
 
 
521 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  30.41 
 
 
299 aa  63.2  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  35.64 
 
 
704 aa  62.4  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  27.36 
 
 
319 aa  62  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  36.27 
 
 
549 aa  62  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  31.25 
 
 
331 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  32.11 
 
 
741 aa  61.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  30.84 
 
 
501 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  30.58 
 
 
343 aa  59.3  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  36.84 
 
 
732 aa  58.9  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  27.5 
 
 
143 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  35.45 
 
 
746 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1818  copper amine oxidase domain protein  32.56 
 
 
527 aa  58.2  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  28.21 
 
 
474 aa  57.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0526  copper amine oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 
456 aa  57  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000165573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  36.79 
 
 
547 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  34.51 
 
 
589 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2648  copper amine oxidase domain protein  38.16 
 
 
620 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  36.63 
 
 
758 aa  56.6  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  30.33 
 
 
763 aa  55.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  35.45 
 
 
781 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  37.25 
 
 
372 aa  55.5  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  34.29 
 
 
754 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  28.8 
 
 
421 aa  54.7  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  26.24 
 
 
502 aa  54.7  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  31.86 
 
 
418 aa  54.3  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  31.31 
 
 
650 aa  53.9  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  27.54 
 
 
450 aa  53.9  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  30.1 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  29.63 
 
 
289 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1371  copper amine oxidase domain protein  34.44 
 
 
531 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000791352  hitchhiker  0.00000351269 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  29.13 
 
 
366 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2788  copper amine oxidase domain-containing protein  34.58 
 
 
270 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  33.64 
 
 
792 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2591  copper amine oxidase domain protein  28.38 
 
 
298 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.066327  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  34.95 
 
 
298 aa  51.6  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  24.18 
 
 
950 aa  51.6  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  33 
 
 
652 aa  51.6  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.195333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>