109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0140 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0140  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  764    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4153  copper amine oxidase domain protein  31.02 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  hitchhiker  0.0000000469459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  33.51 
 
 		 781 aa  119  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0137  hypothetical protein  65 
 
 		 91 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  36.89 
 
 		 741 aa  87  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  31.3 
 
 		 625 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0139  hypothetical protein  35.34 
 
 		 758 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  30 
 
 		 383 aa  80.9  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  36.75 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1643  copper amine oxidase domain protein  34.4 
 
 		 763 aa  75.5  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00153148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  30.89 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1215  copper amine oxidase domain-containing protein  33.82 
 
 		 784 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000445409  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0546  copper amine oxidase domain protein  31.85 
 
 		 749 aa  74.7  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2121  copper amine oxidase domain-containing protein  32.12 
 
 		 704 aa  72.8  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000127816  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  27.61 
 
 		 754 aa  71.6  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  32.9 
 
 		 845 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  33.85 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.61 
 
 		 431 aa  68.2  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  27.07 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  30 
 
 		 589 aa  68.6  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  29.17 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.5 
 
 		 657 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  29.51 
 
 		 763 aa  65.5  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1004  copper amine oxidase-like  25.85 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0001699 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  30.99 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2073  copper amine oxidase-like  28.81 
 
 		 652 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.195333 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  37.8 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0818  copper amine oxidase domain-containing protein  29.37 
 
 		 289 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2153  copper amine oxidase domain protein  28.46 
 
 		 1118 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0231006  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3142  copper amine oxidase domain-containing protein  31.82 
 
 		 746 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000196448  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  36.28 
 
 		 591 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  30.47 
 
 		 792 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 		 452 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  33.94 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  30.7 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  27.45 
 
 		 447 aa  60.5  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  27.83 
 
 		 450 aa  59.7  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  30.08 
 
 		 501 aa  59.3  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1339  copper amine oxidase domain protein  27.78 
 
 		 450 aa  59.3  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.589788  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0939  copper amine oxidase domain-containing protein  30.91 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2678  copper amine oxidase domain-containing protein  27.62 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2496  copper amine oxidase domain protein  31.58 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0179938 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  34.58 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  32.17 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  26.92 
 
 		 153 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2788  copper amine oxidase domain-containing protein  36.05 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.83437  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0384  copper amine oxidase domain-containing protein  32.77 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  31.25 
 
 		 547 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  30.83 
 
 		 1176 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  31.25 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  36.56 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  28.57 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  35.16 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  35.16 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  35.38 
 
 		 267 aa  57  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  35.38 
 
 		 262 aa  57  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  33.63 
 
 		 113 aa  56.2  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  30.09 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  37.25 
 
 		 182 aa  55.5  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  34.38 
 
 		 269 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  35.38 
 
 		 266 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2343  copper amine oxidase-like  28.44 
 
 		 751 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.741245 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  25.44 
 
 		 451 aa  55.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  29.2 
 
 		 426 aa  55.1  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  29.57 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  29.06 
 
 		 423 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  31.96 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  28.7 
 
 		 451 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  27.33 
 
 		 1305 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2494  copper amine oxidase domain protein  28.83 
 
 		 784 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0315716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2432  copper amine oxidase domain protein  26.27 
 
 		 454 aa  53.9  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.43 
 
 		 907 aa  53.1  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0744  copper amine oxidase-like protein  35.96 
 
 		 950 aa  53.1  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0284695  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  30.7 
 
 		 340 aa  53.1  0.000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  28.81 
 
 		 495 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  30 
 
 		 480 aa  53.1  0.000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  28.7 
 
 		 418 aa  52.8  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1575  copper amine oxidase-like  26.67 
 
 		 176 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000369494  normal  0.0457717 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  26.52 
 
 		 298 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  31.86 
 
 		 650 aa  52.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  38.71 
 
 		 481 aa  52.4  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.43 
 
 		 657 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  29.52 
 
 		 403 aa  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  32.14 
 
 		 948 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  28.69 
 
 		 732 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  33.33 
 
 		 262 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  25.93 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  22.52 
 
 		 331 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  32.54 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  31.67 
 
 		 281 aa  49.3  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  31.96 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  28.3 
 
 		 216 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  37.7 
 
 		 541 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  34 
 
 		 529 aa  47.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  30.1 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0892  Rhodanese domain protein  39.62 
 
 		 239 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0596702  hitchhiker  0.0000457584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.35 
 
 		 411 aa  46.6  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  46.51 
 
 		 553 aa  46.2  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  24.07 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  26.17 
 
 		 521 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>