108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1644 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 446 aa  919    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1790  copper amine oxidase-like  55.35 
 
 		 428 aa  485  1e-136  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0436  copper amine oxidase domain-containing protein  53.29 
 
 		 471 aa  454  1.0000000000000001e-126  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  45.15 
 
 		 452 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  35.87 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1228  cell wall hydrolase/autolysin  42.21 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000450762  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3687  cell wall hydrolase/autolysin  36.73 
 
 		 450 aa  93.2  9e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3791  cell wall hydrolase/autolysin  36.81 
 
 		 450 aa  91.3  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0488  putative lipoprotein  33.71 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.241796  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  26.94 
 
 		 1805 aa  80.5  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.69 
 
 		 431 aa  76.6  0.0000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  35.81 
 
 		 423 aa  74.7  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  34.9 
 
 		 182 aa  72.8  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0538  hypothetical protein  32.39 
 
 		 204 aa  72.4  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00554774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0066  cell wall hydrolase/autolysin  31.61 
 
 		 450 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  36.81 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.19 
 
 		 657 aa  67  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.94 
 
 		 907 aa  66.6  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  31.98 
 
 		 591 aa  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  34.9 
 
 		 281 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  27.22 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.01 
 
 		 483 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1705  hypothetical protein  32.31 
 
 		 272 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  29.85 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  27.1 
 
 		 340 aa  60.1  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0523  copper amine oxidase-like  30.16 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000809861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  30.86 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0040  hypothetical protein  30.99 
 
 		 203 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1912  copper amine oxidase-like protein  32.8 
 
 		 535 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000429846  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  35.71 
 
 		 495 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3179  hypothetical protein  35.53 
 
 		 282 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0039  hypothetical protein  30.99 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  32.35 
 
 		 251 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  30.43 
 
 		 763 aa  58.9  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  35.66 
 
 		 529 aa  57.4  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  35.25 
 
 		 113 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  39.05 
 
 		 732 aa  56.6  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  28.29 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  30.72 
 
 		 269 aa  56.2  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  28 
 
 		 291 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  30.7 
 
 		 1176 aa  56.2  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  28.24 
 
 		 763 aa  55.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  34.56 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0786  copper amine oxidase domain protein  29.01 
 
 		 383 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.164384  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  31.01 
 
 		 451 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  28.97 
 
 		 481 aa  54.7  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  31.43 
 
 		 948 aa  54.3  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  26.03 
 
 		 332 aa  53.9  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  26.9 
 
 		 502 aa  53.9  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  32.17 
 
 		 262 aa  53.5  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  28.57 
 
 		 521 aa  53.5  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.04 
 
 		 657 aa  53.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2424  copper amine oxidase-like protein  26.83 
 
 		 276 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.223799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2746  copper amine oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 143 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  29.79 
 
 		 418 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  27.33 
 
 		 323 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  31.03 
 
 		 547 aa  51.2  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2692  copper amine oxidase domain protein  25.23 
 
 		 514 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  31.3 
 
 		 331 aa  51.2  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  29.75 
 
 		 266 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  32 
 
 		 269 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  30.56 
 
 		 781 aa  50.1  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  30.67 
 
 		 298 aa  50.1  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  32 
 
 		 269 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  28.68 
 
 		 845 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  34.75 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  27.42 
 
 		 718 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2648  copper amine oxidase domain protein  41.38 
 
 		 620 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0501  copper amine oxidase domain protein  27.52 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  32.23 
 
 		 625 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 650 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  28.7 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  29.91 
 
 		 263 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  26.9 
 
 		 259 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  31.01 
 
 		 262 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0561  copper amine oxidase domain protein  26.32 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.308888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  34.65 
 
 		 249 aa  47.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  32.54 
 
 		 267 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2371  copper amine oxidase domain protein  24.55 
 
 		 1305 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  27.88 
 
 		 214 aa  47.8  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  25.13 
 
 		 319 aa  47.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  25.32 
 
 		 299 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0754  copper amine oxidase domain protein  25.82 
 
 		 589 aa  47  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  26.35 
 
 		 269 aa  46.6  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  23.97 
 
 		 418 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2786  hypothetical protein  32.86 
 
 		 154 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.155688  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  28.81 
 
 		 480 aa  45.8  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  28.95 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0524  copper amine oxidase domain protein  33.94 
 
 		 304 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2689  hypothetical protein  30.61 
 
 		 212 aa  45.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  32.22 
 
 		 553 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  34.95 
 
 		 890 aa  45.8  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0044  copper amine oxidase domain protein  26.96 
 
 		 754 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00564883  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0133  hypothetical protein  25.58 
 
 		 741 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0757  copper amine oxidase domain protein  29.06 
 
 		 343 aa  45.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4080  copper amine oxidase domain protein  25.83 
 
 		 501 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  46.81 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0627  copper amine oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 		 153 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00936982  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  27.78 
 
 		 372 aa  44.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  26.55 
 
 		 792 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>