15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0040 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0040  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  418  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0039  hypothetical protein  98.03 
 
 
201 aa  407  1e-113  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3791  cell wall hydrolase/autolysin  34.03 
 
 
450 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0488  putative lipoprotein  34.65 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.241796  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3687  cell wall hydrolase/autolysin  32.87 
 
 
450 aa  65.9  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  35.1 
 
 
452 aa  63.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1228  cell wall hydrolase/autolysin  30.13 
 
 
438 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000450762  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0436  copper amine oxidase domain-containing protein  30.43 
 
 
471 aa  62  0.000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0066  cell wall hydrolase/autolysin  30.07 
 
 
450 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2689  hypothetical protein  30.46 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  30.99 
 
 
446 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1790  copper amine oxidase-like  33.33 
 
 
428 aa  56.2  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  31.08 
 
 
403 aa  56.6  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0538  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  54.7  0.0000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00554774  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0888  cell wall hydrolase/autolysin  29.71 
 
 
890 aa  45.8  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000852469  normal  0.142876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>