80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2648 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2648  copper amine oxidase domain protein  100 
 
 
620 aa  1233    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1011  hypothetical protein  30.79 
 
 
428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.906042  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0920  hypothetical protein  25.97 
 
 
406 aa  117  7.999999999999999e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000609095  unclonable  4.61706e-23 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0657  hypothetical protein  25.08 
 
 
351 aa  98.2  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.74 
 
 
657 aa  71.2  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1778  copper amine oxidase-like protein  28.02 
 
 
319 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103341  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.67 
 
 
431 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1827  copper amine oxidase-like protein  40.96 
 
 
323 aa  65.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.19527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2286  hypothetical protein  25.23 
 
 
182 aa  64.3  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0901  copper amine oxidase domain protein  46.48 
 
 
340 aa  61.2  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.948767  normal  0.18587 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0367  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
303 aa  60.5  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024896 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  43.84 
 
 
323 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4298  copper amine oxidase domain protein  43.24 
 
 
452 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0700285  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3228  copper amine oxidase-like protein  37.5 
 
 
266 aa  57.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1020  copper amine oxidase domain protein  44.44 
 
 
481 aa  57.8  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.514045  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0045  copper amine oxidase-like protein  36.11 
 
 
269 aa  57.4  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1536  copper amine oxidase domain protein  40.43 
 
 
331 aa  57.4  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000116317 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0958  copper amine oxidase domain protein  38.03 
 
 
423 aa  57.4  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.990668  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3226  copper amine oxidase-like protein  37.5 
 
 
262 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0047  copper amine oxidase-like protein  25 
 
 
269 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0243  copper amine oxidase-like protein  45.76 
 
 
282 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0048  copper amine oxidase-like protein  25 
 
 
269 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0593  copper amine oxidase-like protein  29.73 
 
 
332 aa  55.5  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2489  copper amine oxidase domain protein  32.26 
 
 
291 aa  55.1  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3227  copper amine oxidase-like protein  36.11 
 
 
267 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1258  copper amine oxidase-like protein  29.41 
 
 
259 aa  55.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0382  copper amine oxidase-like protein  26.46 
 
 
403 aa  54.7  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0824  copper amine oxidase-like protein  54.76 
 
 
591 aa  54.3  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195798  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3690  copper amine oxidase domain protein  50 
 
 
216 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2061  copper amine oxidase domain protein  46.67 
 
 
521 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000589284  hitchhiker  0.0000623397 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  39.71 
 
 
483 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  46 
 
 
478 aa  52.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0892  Rhodanese domain protein  26.67 
 
 
239 aa  52.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0596702  hitchhiker  0.0000457584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.77 
 
 
657 aa  51.6  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2411  copper amine oxidase domain protein  42 
 
 
763 aa  51.6  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00639919  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  40.85 
 
 
451 aa  51.6  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0744  copper amine oxidase domain-containing protein  57.89 
 
 
418 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0126  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 
907 aa  51.2  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0729  copper amine oxidase domain-containing protein  41.67 
 
 
426 aa  50.8  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2029  hypothetical protein  26.13 
 
 
286 aa  50.8  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.115384  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1566  copper amine oxidase domain-containing protein  40.62 
 
 
251 aa  50.8  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1374  copper amine oxidase-like protein  30.56 
 
 
262 aa  50.4  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000174509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1644  copper amine oxidase domain-containing protein  41.38 
 
 
446 aa  49.3  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2654  hypothetical protein  30.17 
 
 
234 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0476223  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  38.18 
 
 
480 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0665  hypothetical protein  64.52 
 
 
529 aa  49.3  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000994581  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1833  copper amine oxidase-like protein  34.29 
 
 
269 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1842  copper amine oxidase domain protein  41.07 
 
 
553 aa  49.7  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3188  copper amine oxidase-like protein  58.82 
 
 
495 aa  49.7  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000368192  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2410  copper amine oxidase domain protein  43.75 
 
 
792 aa  48.1  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0185  cell wall hydrolase/autolysin  42.86 
 
 
948 aa  48.1  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00443483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0587  copper amine oxidase domain protein  60.61 
 
 
263 aa  48.1  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00651407  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1790  copper amine oxidase-like  38.89 
 
 
428 aa  47.8  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0436  copper amine oxidase domain-containing protein  36.84 
 
 
471 aa  47.8  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1598  copper amine oxidase domain protein  50 
 
 
418 aa  47.4  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1871  glycosyl hydrolase-like protein  42 
 
 
451 aa  47.4  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00112913  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1857  copper amine oxidase-like  34.33 
 
 
214 aa  46.6  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.021066  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  42.86 
 
 
372 aa  47  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  39.74 
 
 
547 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0361  copper amine oxidase domain protein  40.82 
 
 
549 aa  46.6  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.977127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1055  copper amine oxidase domain-containing protein  37.93 
 
 
541 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000877953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2119  copper amine oxidase domain-containing protein  38 
 
 
429 aa  46.2  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00100028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2109  copper amine oxidase-like protein  51.43 
 
 
845 aa  46.2  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1126  copper amine oxidase domain protein  53.33 
 
 
292 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0706  copper amine oxidase domain-containing protein  35 
 
 
298 aa  45.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2367  copper amine oxidase-like  46.34 
 
 
249 aa  45.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0176412  decreased coverage  0.00000016628 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  33.72 
 
 
574 aa  45.8  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0847  copper amine oxidase domain-containing protein  51.35 
 
 
650 aa  45.4  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4154  copper amine oxidase domain protein  33.33 
 
 
781 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000308518  hitchhiker  0.000000100908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3147  copper amine oxidase domain protein  26.88 
 
 
331 aa  45.4  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.407665  normal  0.91906 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0402  copper amine oxidase-like protein  54.05 
 
 
732 aa  45.4  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000691297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1627  SpoIID/LytB domain protein  26.79 
 
 
625 aa  45.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.637153  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1514  copper amine oxidase domain-containing protein  40.43 
 
 
281 aa  45.1  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0779  copper amine oxidase-like protein  56.67 
 
 
450 aa  45.1  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  38 
 
 
1176 aa  45.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2146  copper amine oxidase-like protein  55.88 
 
 
113 aa  44.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0130  copper amine oxidase domain protein  50 
 
 
414 aa  44.3  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3230  copper amine oxidase domain protein  33.77 
 
 
299 aa  44.3  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.41019  normal  0.147437 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0712  copper amine oxidase domain-containing protein  44.68 
 
 
175 aa  44.3  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  33.8 
 
 
502 aa  43.5  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>